matplotlib 中带有散点图和使用 set_offsets 的动画:图形的自动缩放不起作用
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【中文标题】matplotlib 中带有散点图和使用 set_offsets 的动画:图形的自动缩放不起作用【英文标题】:Animation in matplotlib with scatter and using set_offsets: Autoscale of figure is not working 【发布时间】:2017-04-28 07:51:40 【问题描述】:我正在使用 matplotlib 在 python GUI 中使用动画进行绘图。下面是代码
import sys
from PyQt4 import QtGui
from matplotlib.backends.backend_qt4agg import FigureCanvasQTAgg as FigureCanvas
from matplotlib.backends.backend_qt4agg import NavigationToolbar2QT as NavigationToolbar
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.animation
import numpy as np
class Window(QtGui.QDialog):
def __init__(self, parent=None):
super(Window, self).__init__(parent)
self.figure = plt.figure()
self.canvas = FigureCanvas(self.figure)
self.toolbar = NavigationToolbar(self.canvas, self)
layout = QtGui.QVBoxLayout()
layout.addWidget(self.toolbar)
layout.addWidget(self.canvas)
self.setLayout(layout)
self.ax=self.figure.add_subplot(111)
plt.autoscale(enable=True, axis='both', tight=None #for auto scaling
self.data = [500, -500, 501, -502,.... 623] #some list of data
self.ax = plt.gca()
self.ax.grid()
self.sc = self.ax.scatter(self.data[::2], self.data[1::2]
def plot(self, a):
for i in range(len(self.data)):
self.data[i] = int(self.data[i])+5
self.sc.set_offsets(np.c_[self.data[::2], self.data[1::2]])
self.canvas.draw()
if __name__ == '__main__':
app = QtGui.QApplication(sys.argv)
main = Window()
ani = matplotlib.animation.FuncAnimation(main.figure, main.plot,
frames=4, interval=100, repeat=True)
main.show()
sys.exit(app.exec_())
我正在使用动画调用的绘图函数中的 set_offsets 更新绘图。当绘图值不断增加并且绘图完成时,绘图会变得不正常。所以我使用了自动缩放()。但它不工作。静止轴保持固定,绘图消失。 请帮助我在图中进行自动缩放。提前致谢。
【问题讨论】:
我相信它现在看起来不错.. @ImportanceOfBeingErnest 【参考方案1】:问题是在自动缩放轴时没有考虑散射偏移。这可能是一个错误,或者是一个期望的特性;无论如何,两种解决方法是:
使用plot
在许多情况下可以接受的一种解决方法是使用线图plt.plot
而不是plt.scatter
。在这种情况下,可以使用ax.relim
后跟ax.autoscale_view()
自动缩放轴。
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.animation
import numpy as np
fig, ax = plt.subplots()
ax.grid()
data = np.cumsum(np.random.normal(size=100)) #some list of data
sc, = ax.plot(data[::2], data[1::2], marker="o", ls="") # set linestyle to none
def plot(a, data):
data += np.cumsum(np.random.normal(size=100)+3e-2)
sc.set_data(data[::2], data[1::2])
ax.relim()
ax.autoscale_view(True,True,True)
ani = matplotlib.animation.FuncAnimation(fig, plot, fargs=(data,),
frames=4, interval=100, repeat=True)
plt.show()
使用scatter
并以编程方式设置限制
如果不能使用上述方法(例如,因为散点应该具有不同的大小或颜色),则需要根据数据更新限制。
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.animation
import numpy as np
fig, ax = plt.subplots()
data = np.cumsum(np.random.normal(size=100)) #some list of data
ax.grid()
sc = ax.scatter(data[::2], data[1::2], c=data[1::2])
def plot(a, data):
data += np.cumsum(np.random.normal(size=100)+3e-2)
X = np.c_[data[::2], data[1::2]]
sc.set_offsets(X)
# manually relim:
xmin=X[:,0].min(); xmax=X[:,0].max()
ymin=X[:,1].min(); ymax=X[:,1].max()
ax.set_xlim(xmin-0.1*(xmax-xmin),xmax+0.1*(xmax-xmin))
ax.set_ylim(ymin-0.1*(ymax-ymin),ymax+0.1*(ymax-ymin))
ani = matplotlib.animation.FuncAnimation(fig, plot, fargs=(data,),
frames=4, interval=100, repeat=True)
plt.show()
【讨论】:
当我尝试这种方法时,我得到了一个回溯'AttributeError:'PathCollection'对象没有属性'set_xlim''。请问有什么想法吗? 没有。首先,上面有两种方法。不清楚你拿的是哪一个。其次,两者都按原样工作。如果你改变了什么,别人怎么会知道你改变了什么。因此,没有人可以帮助您,除非您提供问题的minimal reproducible example。最好通过提出一个新问题来做到这一点。 感谢您的回复。我用的是第二种方法。我在 PathCollection 而不是轴对象上错误地调用了 set_xlim。它现在正在工作。 感谢发帖。 是否可以添加更新趋势线以及散点?以上是关于matplotlib 中带有散点图和使用 set_offsets 的动画:图形的自动缩放不起作用的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
转录组scatter plot 散点图和ma plot有啥区别