如何为箭头包安装 C++ 依赖项？

Posted 2023-03-28

【中文标题】如何为箭头包安装 C++ 依赖项？

【英文标题】：How to install C++ dependencies for the arrow package?

【发布时间】：2021-12-30 19:10:50

【问题描述】：

我正在尝试在基于 linux 的 R 会话中下载一个包（我也有终端访问权限）。它需要特定的 C++ 依赖项，但我不知道如何安装它们。

由于我在一家公司的服务器后面，他们限制了我们对网络的访问。而且所有包都有一个工件，我必须指向它才能下载包。

例如：我已经能够以这种方式设置更改 repo 以从 CRAN 安装软件包（我已经掩盖了网站的 ***）：

r <- getOption("repos")
r["CRAN"] <- "https://***.***.***/artifactory/r-project-cran/"
options(repos = r)
options(download.file.method = "curl")
options(download.file.extra = "--insecure")

但是现在我遇到了其中一个包所需的特定依赖项的问题。特别是“箭头”包。

例如，我去了：

install.packages("arrow", dependencies=TRUE,type="source")
Installing package into ‘/***/***/R’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning: unable to access index for repository https://***.***.***/artifactory/list/cran-r/src/contrib:
  Line starting ' ...' is malformed!
  % Total    % Received % Xferd  Average Speed   Time    Time     Time  Current
                                 Dload  Upload   Total   Spent    Left  Speed
100 4662k  100 4662k    0     0  5268k      0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 5262k
* installing *source* package ‘arrow’ ...
** package ‘arrow’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
curl: (6) Could not resolve host: github.com
*** Proceeding without C++ dependencies
------------------------- NOTE ---------------------------
There was an issue preparing the Arrow C++ libraries.
See https://arrow.apache.org/docs/r/articles/install.html
---------------------------------------------------------
ERROR: configuration failed for package ‘arrow’
* removing ‘/***/***/R/arrow’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/Rtmpu2u1d3/downloaded_packages’

有人知道我需要采取哪些具体步骤来解决此问题吗？ 有没有办法改变curl命令并将其指向公司的神器为github？ 或者，预先安装箭头 C++ 库？

【参考方案1】：

如果您可以控制将哪个版本的arrow 放入您的工件服务器，您可以准备一个包含所有 C++ 依赖项的“胖”箭头源包。这是箭头 6.0.0 中添加的新实用程序功能。有关如何执行此操作的说明，请参阅 https://arrow.apache.org/docs/r/reference/create_package_with_all_dependencies.html。

您还可以安装官方 Apache Arrow 系统包，如 https://arrow.apache.org/install/ 中所述。这里的缺点是您必须保持这些库和 R 包的版本同步；如果您只升级一个而没有另一个，它将无法正常工作。 https://arrow.apache.org/docs/r/articles/install.html 对此进行了进一步讨论。

【讨论】：

嘿尼尔！谢谢你回到我身边。我刚刚遇到了一个问题，我按照说明创建了一个“胖”包装……但它似乎坏了。我在不同的计算机上尝试过===> create_package_with_all_dependencies("my_arrow_pkg.tar.gz") 出错：无法下载第三方依赖项

你知道功能是否损坏吗？我也在家里的电脑上试过，结果一样。

我们在 CI 中使用 test this workflow，但是看看这个函数，如果它能够在失败时为您提供更详细的输出，那就太好了。你介意opening a JIRA issue 让我们调查一下吗？