将数据写入闪亮应用程序的不同目录

Posted 2023-03-24

【中文标题】将数据写入闪亮应用程序的不同目录

【英文标题】：Write data to different directory for shiny-app

【发布时间】：2018-01-31 10:16:32

【问题描述】：

我有一个在 Linux 上运行闪亮服务器的闪亮应用程序。按照我的设置，应用程序位于/srv/shiny-server/app-dir/。

我想使用我放在一起的.R 文件将文件写入该目录以供我的闪亮应用程序读取。在那个文件中，我这样写数据：write.csv(df, "file.csv")。如果我从我的闪亮应用目录运行这个文件 Rscript /srv/shiny-server/app-dir/write_script.R，它将数据写入/home/ec2-user。

如果我将write 命令更改为write.csv(df, '/srv/shiny-server/app-dir/data.csv') 并以同样的方式运行它不起作用（权限被拒绝）。

我也不能从我的闪亮应用程序中读取/home/ec2-user/ 中的文件。

所以我的问题是：考虑到上面概述的文件夹结构，我如何从 R 脚本（不是闪亮应用中的 server.R 文件）写入闪亮应用可以访问的文件？

【参考方案1】：

Shiny Apps 由用户shiny 执行，该用户无权访问用户ec2-user 的home 目录。将文件复制到/srv/shiny-server/app-dir后即可更改文件的读取权限：

使用 linux 命令：chmod a+r /srv/shiny-server/app-dir/file.csv 使用 R 命令：system2("chmod", list("a+r", "/srv/shiny-server/app-dir/file.csv")

【讨论】：

我认为我的问题不在于.csv 文件的权限，而是首先将文件放入/srv/shiny-server 目录。我不知道system2 函数，这在我编写.csv 以将文件移动到/srv/shiny-server 的脚本中是否有效？类似：system2("cp", list("/home/ec2-user/file.csv", "/srv/shiny-server/app-dir))。我可以将sudo 添加到system2 并让它工作吗？