rpy2的Anaconda导入错误

Posted 2023-03-13

【中文标题】rpy2的Anaconda导入错误

【英文标题】：Anaconda import error for rpy2

【发布时间】：2016-08-11 20:11:06

【问题描述】：

我在 Anaconda Python 上使用 rpy2 时遇到问题。问题是由于以下 TypeError 导致导入失败：

TypeError: type 'rpy2.rinterface.StrSexpVector' 是不可接受的 基本类型

我的python版本是3.5，我的anaconda版本是4.0.0，我的rpy2版本是2.7.0。

问题似乎是 Anaconda 现在使用的 3.5 版本与 rpy2 2.7.3 或更低版本不兼容，请参阅https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/issues/313/typeerror-type-rpy2rinterfacestrsexpvector - 因为 Anaconda 当前默认安装 2.7.0，所以导入失败。如何解决这个问题？

这个问题与这里提出的问题类似，Error when loading rpy2 with anaconda，但是，安装 2.7.0 的旧解决方案不再兼容，如上所述。

【参考方案1】：

如果你碰巧在 OS X 上，我已经为 rpy2 2.8.0 构建了 Conda 包，你可以使用它：

conda install -c ijstokes rpy2=2.8.0

这些适用于 Python 2.7 和 3.5。问题源于此 rpy2 错误，该错误现已修复：https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/issues/313/typeerror-type-rpy2rinterfacestrsexpvector

如果您不在 OS X 上，那么您可以使用以下内容构建自己的版本：

conda skeleton pypi rpy2 --version=2.8.0 --python=3.5
conda build rpy2
conda install --use-local rpy2

这些命令来自内存，但它们应该可以工作或足够接近您可以找出确切的选项。