为啥 ColumnTransformer 中的 SimpleImputer 会创建额外的列?

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【中文标题】为啥 ColumnTransformer 中的 SimpleImputer 会创建额外的列?【英文标题】:Why is SimpleImputer in ColumnTransformer creating additional Columns?为什么 ColumnTransformer 中的 SimpleImputer 会创建额外的列? 【发布时间】:2021-07-18 20:50:07 【问题描述】:

我正在关注 Aurelion Geron 的机器学习书籍。

我正在试验ColumnTransformer 类。当我包含SimplerImputer 时,会创建一个额外的列。我知道SimplerImputer 用于填充total_bedrooms 列中的缺失值(结果中的列索引4),因此我不清楚它为什么要在结果中添加新列(列索引:10)。

当我不包括 SimplerImputer 来自ColumnTransformer,但创建一个实例,而fit_transformColumnTransformer 的输出,我不会得到额外的列。请指教。

category_att = X.select_dtypes(include='object').columns
num_att = X.select_dtypes(include='number').columns

transformer = ColumnTransformer(
    [
    ('adder', AttributeAdder(), num_att ),
    ('imputer', SimpleImputer(strategy='median'), ['total_bedrooms']),
    ('ohe', OneHotEncoder(), category_att)
    ],
    remainder = 'passthrough'
)

用于添加两个新功能/列的自定义类

class AttributeAdder(BaseEstimator, TransformerMixin):
    
    def __init__(self, add_bed_room = False):
        self.add_bed_room = add_bed_room
    
    def fit(self,y=None):
        return self
    
    def transform(self,X,y=None):
        
        room_per_household = X.iloc[: , t_room ] / X.iloc[: , t_household ]
        population_per_household = X.iloc[: , t_population ] / X.iloc[: , t_household ]
        return np.c_[X,room_per_household,population_per_household]

结果

【问题讨论】:

【参考方案1】:

为什么

不完全是SimpleImputer;这是ColumnTransformer 本身。 ColumnTransformer 并行应用其转换器,而不是按顺序应用(另请参阅[1]、[2]),因此如果将一列传递给多个转换器,您将在输出中多次使用该列。在您的情况下,输出第 4 列来自 total_bedrooms 上的 "adder"(它什么也没做,所以仍然有缺失值),输出第 10 列来自 "imputer"(因此不会有缺失值)。

修复

在这种特殊情况下,两种方法似乎最简单。

推算一切

您的任何没有缺失的数字特征都不会受到影响。但是,如果您希望管道在具有缺失值的 future 数据上出错,请不要这样做。

num_pipe = Pipeline([
    ("add_feat", AttributeAdder()),
    ("impute", SimpleImputer(strategy="median")),
])
transformer = ColumnTransformer(
    [
        ('num', num_pipe, num_att),
        ('cat', OneHotEncoder(), category_att),
    ],
    remainder = 'passthrough',
)

较小的变压器柱组

由于您实际上并不需要您的 total_bedrooms 列作为您的 AttributeAdder,因此您无需将其传递到该转换器。具体情况取决于您如何使用t_roomst_households 等,但通常:

transformer = ColumnTransformer(
    [
        ('adder', AttributeAdder(), [["total_rooms", "households", "population"]]),
        ('imputer', SimpleImputer(strategy='median'), ['total_bedrooms']),
        ('ohe', OneHotEncoder(), category_att)
    ],
    remainder = 'passthrough'  # now you're relying on this one much more
)

在相关方法中,您可以更灵活地计算添加的特征。更改您的AttributeAdder 以返回只是新功能(不要在transform 的最后一步连接到X),并依靠ColumnTransformer 传递这些功能。 (请注意,我们不能依赖remainder,但我们可以使用"passthrough" 作为转换器之一。)

class AttributeAdder(BaseEstimator, TransformerMixin):
    ...
    def transform(self,X,y=None):
        ...
        return np.c_[room_per_household,population_per_household]


transformer = ColumnTransformer(
    [
        ('adder', AttributeAdder(), num_att),
        ('num', "passthrough", num_att.drop(['total_bedrooms'])),
        ('imputer', SimpleImputer(strategy='median'), ['total_bedrooms']),
        ('ohe', OneHotEncoder(), category_att)
    ],
    passthrough=True,  # if you have columns in neither of num_att and category_att that you want kept
)

【讨论】:

以上是关于为啥 ColumnTransformer 中的 SimpleImputer 会创建额外的列?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

将 ColumnTransformer() 结果附加到管道中的原始数据?

featureUnion vs columnTransformer?

特征重要性特征集成+FeatureUnion特征选择变换器+ColumnTransformer标签特征变换+TransformedTargetRegressor特征质量自动学习数据中的特征

Sklearn ColumnTransformer + Pipeline = TypeError

JPA AttributeConverter和Hibernate的ColumnTransformer在属性的加密和解密方面的区别

管道内的 ColumnTransformer