带有 X、Y 数据的 Matplotlib 热图
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【中文标题】带有 X、Y 数据的 Matplotlib 热图【英文标题】:Matplotlib Heatmap with X, Y data 【发布时间】:2019-07-20 13:55:27 【问题描述】:我想使用pcolor
或其他热图库在matplotlib
中制作热图。我找到了很多很好的例子,但无法确定如何以正确的格式获取我的数据,或者使用我的数据所在的格式进行绘图。
这是我的数据的设置方式
X Y Value
0 1 .6
0 2 .3
0 3 .2
1 1 .8
1 2 .4
1 3 .9
因此,X
和 Y
列表示 (X,Y)
对,其中 Value
是相应单元格的值。我正在努力寻找一种方法来转换数据以使用pcolor
或另一种绘图方法。任何帮助将不胜感激。
【问题讨论】:
官方文档中的这个链接提供了一个很好的例子:matplotlib.org/3.1.1/gallery/images_contours_and_fields/… 【参考方案1】:您必须将 x 和 y 值转换为 2D numpy 数组。数组的二维表示 x 和 y,而值映射到热图颜色条。更多彩图给here。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as mpl
import matplotlib.cm as cmap
m = np.array([[.6, .3, .2], [.8, .4, .9]])
mpl.imshow(m, cmap=cmap.hot)
mpl.colorbar()
mpl.show()
产生
【讨论】:
你的代码中没有x,y
关系,你得到了二维矩阵,里面有值,图像是根据你提供的值生成的,它们都索引到3,有一些-half
偏移量【参考方案2】:
看起来您使用的是 pandas 数据框。 在将枢轴数据框绘制为表格并使用热图方法之前,即来自 seaborn:
import seaborn as sns
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
df = pd.read_clipboard()
table = df.pivot('Y', 'X', 'Value')
ax = sns.heatmap(table)
ax.invert_yaxis()
print(table)
plt.show()
输出:
X 0 1
Y
1 0.6 0.8
2 0.3 0.4
3 0.2 0.9
【讨论】:
【参考方案3】:我迟到了,但这里是 OP 问题的解决方案,只使用 matplotlib
,按照要求。它依赖于使用imshow
的extent
选项来完成这项工作。有关详细信息,请参阅matplotlib manual。
import matplotlib.pyplot as plt
xvals = [0,1]
yvals = [1,3]
zvals = [[0.6, 0.3, 0.2], [0.8, 0.4, 0.9]]
heatmap, ax = plt.subplots()
im = ax.imshow(zvals,cmap='inferno',extent=[xvals[0],xvals[1],yvals[0],yvals[1]],interpolation='nearest',origin='lower',aspect='auto')
ax.set(xlabel='some x', ylabel='some y')
cbar = heatmap.colorbar(im)
cbar.ax.set_ylabel('stuff')
heatmap.savefig('heatmap.png')
结果如下图
【讨论】:
以上是关于带有 X、Y 数据的 Matplotlib 热图的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
使用 Matplotlib 在带有图例的热图中显示不同大小的圆圈