如何在 Jupyter Notebook 中选择你的 conda 环境

Posted 2023-02-14

【中文标题】如何在 Jupyter Notebook 中选择你的 conda 环境

【英文标题】：How to choose your conda environment in Jupyter Notebook

【发布时间】：2019-03-25 14:35:23

【问题描述】：

我使用 Python 3.7（根环境）安装了 Anaconda 5.3。 之后我使用 Python 3.6 创建了一个新环境（py36）

我使用activate py36 激活了新环境conda env list 表明该环境处于活动状态。

但是当我启动 Jupyter Notebook（从 Anaconda 提示符 jupyter notebook）时，它似乎使用的是根环境，而不是激活的环境。

如何在新的创建环境 (py36) 中使用 Jupyter Notebook？

【问题讨论】：

我可能已经找到了解决方案。在“主页”菜单的 Anaconda Navigator 中，我在下拉菜单“应用程序打开”中选择了“py36”环境。它可以选择在所选环境中从那里安装 Jupyter Notebook，然后再启动它。在激活新环境后也可以从命令行启动它。我希望有更有效的方法，而不是为每个（新）环境再次安装 Jupyter Notebook。

阅读docs.continuum.io/anaconda/user-guide/tasks/… 的文档，尤其是docs.continuum.io/anaconda/user-guide/tasks/…

【参考方案1】：

我设法在类似问题中找到了解决方案。问题是 IPython 不是 virtualenv-aware，因此一种解决方法（我发现最舒服的一种）是指定自定义 IPython 内核以避免为每个 virtualenv（或 anaconda 环境，在您的情况下）安装一个 Jupyter Notebook .

Jupyter 依赖于存储在您的操作系统某处的一些“内核”（定义在何处查找 python 二进制文件）。这些文件是这样的：

 "display_name": "NameOfTheKernel", 
 "language": "python", 
 "argv": [
  "/usr/bin/python", 
  "-m", 
  "ipykernel_launcher", 
  "-f", 
  "connection_file"
 ]

/usr/bin/python 是要执行的 python 二进制文件的路径。但是，由于这些内核是由 Jupyter 在您计算机中的某个位置定义的，因此当您安装其他一些环境（anaconda 或 virtualenv 就是这种情况）时，它们不会更新。我发现最简单的方法是为您使用的每个环境定义一个自定义内核。此外，这样做可以消除每次您想使用环境时都激活环境的需要，因为它是直接加载的。

这个想法是定义一个自定义内核，以便 Jupyter 可以“看到”您使用 anaconda 创建的环境。为此，请在 bash 中执行以下行：

ipython kernel install --user --name=NameOfTheKernel

“NameOfTheKernel”实际上并没有那么重要。如果您没有 ipython 软件包，请使用 pip、anaconda、sudo apt install 或其他方式安装它。

此行将定义一个自定义内核，jupyter 将检测到该内核。为了便于说明，在 Ubuntu 中，这将存储在文件夹 /home/USERNAME/.local/share/jupyter 中，具有以下数据结构：

/home/USERNAME/.local/share/jupyter/kernels/
└── nameofthekernel
    ├── kernel.json
    ├── logo-32x32.png
    └── logo-64x64.png

安装内核后，您必须：

1) 了解 anaconda 安装环境的位置。一个简单的方法是在 anaconda 中激活您的环境，然后在终端中编写“which python”。这将显示二进制文件的完整路径。

2) 在刚刚创建的 jupyter 内核中写入该路径。例如。使用 pluma：

pluma /home/USERNAME/.local/share/jupyter/kernels/nameofthekernel/kernel.json

然后，您将安装的 python 二进制文件的路径替换为 /usr/bin/python 所在的 anaconda。

此后，如果 Jupyter 正在运行，请重新启动它。这样，下次打开 Jupyter 时，您可以更改内核（在笔记本中，上部的选项卡之一），您将使用您的环境以及与该环境一起安装的所有内容。

[TL;DR] 我用 pip 做到了，但是 anaconda 的步骤或多或少是相同的。步骤是：

#CREATE THE IPYTHON KERNELS
ipython kernel install --user --name=NameOfKernel
#IF PYTHON2 - MODIFY THE KERNELS TO USE THE ANACONDA BINARIES
sed -i -e "s|/usr/bin/python3|/home/$USER/anaconda/bin/python27|g" /home/$USER/.local/share/jupyter/kernels/nameofkernel/kernel.json
#IF PYTHON3 - MODIFY THE KERNELS TO USE THE ANACONDA BINARIES
sed -i -e "s|/usr/bin/python3|/home/$USER/anaconda/bin/python36|g" /home/$USER/.local/share/jupyter/kernels/nameofkernel/kernel.json

或者，如果您正在使用环境：

#CREATE THE IPYTHON KERNELS
ipython kernel install --user --name=NameOfKernel
#IF PYTHON2 - MODIFY THE KERNELS TO USE THE ANACONDA BINARIES
sed -i -e "s|/usr/bin/python3|/home/$USER/anaconda/envs/nameofenvironment/python27|g" /home/$USER/.local/share/jupyter/kernels/nameofkernel/kernel.json
#IF PYTHON3 - MODIFY THE KERNELS TO USE THE ANACONDA BINARIES
sed -i -e "s|/usr/bin/python3|/home/$USER/anaconda/envs/nameofenvironment/python36|g" /home/$USER/.local/share/jupyter/kernels/nameofkernel/kernel.json

注意：我没有安装 CONDA 来测试解决方案，因此导致实际 Python 二进制文件的路径可能会改变。但是，过程是相同的。

【参考方案2】：

正如@Ista 提到的，该文档提供了一个使用笔记本扩展的简单解决方案。

conda install nb_conda

安装后，您可以在 Jupyter Notebook 中从 Jupyter Notebook 的“内核”菜单中选择“更改内核”。