我们如何在与 joblib 的并行执行中使用 tqdm?
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【中文标题】我们如何在与 joblib 的并行执行中使用 tqdm?【英文标题】:How can we use tqdm in a parallel execution with joblib? 【发布时间】:2016-10-14 17:30:31 【问题描述】:我想并行运行一个函数,并等待所有并行节点完成,使用 joblib。就像在示例中一样:
from math import sqrt
from joblib import Parallel, delayed
Parallel(n_jobs=2)(delayed(sqrt)(i ** 2) for i in range(10))
但是,我希望像 tqdm 一样在单个进度条中看到执行,显示已完成的作业数。
你会怎么做?
【问题讨论】:
danshiebler.com/2016-09-14-parallel-progress-bar 也许这个网站可以帮到你。 看看下面的 niedakh! 【参考方案1】:只需将range(10)
放入tqdm(...)
!这对你来说可能看起来太好了,但它确实有效(在我的机器上):
from math import sqrt
from joblib import Parallel, delayed
from tqdm import tqdm
result = Parallel(n_jobs=2)(delayed(sqrt)(i ** 2) for i in tqdm(range(100000)))
【讨论】:
这仅在进程开始时显示进度,而不是在完成时显示:Parallel(n_jobs=10)(delayed(time.sleep)(i ** 2) for i in tqdm(range(10)))
它可以工作,但不适用于例如字符串列表...还尝试将列表包装在iter
...
@curious95 尝试将列表放入生成器,以下似乎对我有用:from math import sqrt from joblib import Parallel, delayed import multiprocessing from tqdm import tqdm rng = range(100000) rng = ['a','b','c','d'] for j in range(20): rng += rng def get_rng(): i = 0 for i in range(len(rng)): yield rng[i] result = Parallel(n_jobs=2)(delayed(sqrt)(len(i) ** 2) for i in tqdm(get_rng()))
另外一个问题,有一个很优雅的solution来解决这个问题。
这行不通,tqdm
将立即转到 %100。【参考方案2】:
我已经创建了 pqdm 一个并行的 tqdm 包装器,它带有并发的未来来轻松完成这项工作,试一试!
安装
pip install pqdm
并使用
from pqdm.processes import pqdm
# If you want threads instead:
# from pqdm.threads import pqdm
args = [1, 2, 3, 4, 5]
# args = range(1,6) would also work
def square(a):
return a*a
result = pqdm(args, square, n_jobs=2)
【讨论】:
干得好家伙!无法忍受你为什么不被接受。非常感谢! 不幸的是,这对我来说失败了。我不知道为什么,但看起来 pqdm 并没有等到函数调用结束。我现在没有时间创建 MWE。不过,感谢您的努力(和 +1)。 @YairDaon 可能会尝试使用有界执行器,尝试将bounded=True
添加到 pqdm。
这就像一个魅力,感谢图书馆。有帮助!
它是否适用于列表理解?【参考方案3】:
修改 nth's great answer 以允许动态标志使用或不使用 TQDM,并提前指定总数,以便正确填写状态栏。
from tqdm.auto import tqdm
from joblib import Parallel
class ProgressParallel(Parallel):
def __init__(self, use_tqdm=True, total=None, *args, **kwargs):
self._use_tqdm = use_tqdm
self._total = total
super().__init__(*args, **kwargs)
def __call__(self, *args, **kwargs):
with tqdm(disable=not self._use_tqdm, total=self._total) as self._pbar:
return Parallel.__call__(self, *args, **kwargs)
def print_progress(self):
if self._total is None:
self._pbar.total = self.n_dispatched_tasks
self._pbar.n = self.n_completed_tasks
self._pbar.refresh()
【讨论】:
【参考方案4】:如上所述,仅包装传递给joblib.Parallel()
的可迭代的解决方案并不能真正监控执行进度。相反,我建议继承 Parallel
并覆盖 print_progress()
方法,如下所示:
import joblib
from tqdm.auto import tqdm
class ProgressParallel(joblib.Parallel):
def __call__(self, *args, **kwargs):
with tqdm() as self._pbar:
return joblib.Parallel.__call__(self, *args, **kwargs)
def print_progress(self):
self._pbar.total = self.n_dispatched_tasks
self._pbar.n = self.n_completed_tasks
self._pbar.refresh()
【讨论】:
【参考方案5】:这里是可能的解决方法
def func(x):
time.sleep(random.randint(1, 10))
return x
def text_progessbar(seq, total=None):
step = 1
tick = time.time()
while True:
time_diff = time.time()-tick
avg_speed = time_diff/step
total_str = 'of %n' % total if total else ''
print('step', step, '%.2f' % time_diff,
'avg: %.2f iter/sec' % avg_speed, total_str)
step += 1
yield next(seq)
all_bar_funcs =
'tqdm': lambda args: lambda x: tqdm(x, **args),
'txt': lambda args: lambda x: text_progessbar(x, **args),
'False': lambda args: iter,
'None': lambda args: iter,
def ParallelExecutor(use_bar='tqdm', **joblib_args):
def aprun(bar=use_bar, **tq_args):
def tmp(op_iter):
if str(bar) in all_bar_funcs.keys():
bar_func = all_bar_funcs[str(bar)](tq_args)
else:
raise ValueError("Value %s not supported as bar type"%bar)
return Parallel(**joblib_args)(bar_func(op_iter))
return tmp
return aprun
aprun = ParallelExecutor(n_jobs=5)
a1 = aprun(total=25)(delayed(func)(i ** 2 + j) for i in range(5) for j in range(5))
a2 = aprun(total=16)(delayed(func)(i ** 2 + j) for i in range(4) for j in range(4))
a2 = aprun(bar='txt')(delayed(func)(i ** 2 + j) for i in range(4) for j in range(4))
a2 = aprun(bar=None)(delayed(func)(i ** 2 + j) for i in range(4) for j in range(4))
【讨论】:
这是一个四处走走,但进度条只有在分派任务时才会更新。更新进度条的更好时机是任务完成的时间。【参考方案6】:如果您的问题由多个部分组成,您可以将这些部分拆分为k
子组,并行运行每个子组并更新其间的进度条,从而使k
更新进度。
这在文档中的以下示例中得到了演示。
>>> with Parallel(n_jobs=2) as parallel:
... accumulator = 0.
... n_iter = 0
... while accumulator < 1000:
... results = parallel(delayed(sqrt)(accumulator + i ** 2)
... for i in range(5))
... accumulator += sum(results) # synchronization barrier
... n_iter += 1
https://pythonhosted.org/joblib/parallel.html#reusing-a-pool-of-workers
【讨论】:
这如何回答关于“单个进度条”的问题? 这绝对不能回答关于进度条的问题以上是关于我们如何在与 joblib 的并行执行中使用 tqdm?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章