具有特定位置的networkx add_node

Posted 2023-02-16

【中文标题】具有特定位置的networkx add_node

【英文标题】：networkx add_node with specific position

【发布时间】：2012-08-02 00:48:51

【问题描述】：

我还是 networkx 的初学者 我想在不同位置添加多种类型的节点，我使用了以下代码

pos = 0: (40, 20), 1: (20, 30), 2: (40, 30), 3: (30, 10) 
X=nx.Graph()
nx.draw_networkx_nodes(X,pos,node_size=3000,nodelist=[0,1,2,3],node_color='r')

但是当我想访问 Graph X 时，如果我输入 X.node 它会返回一个空列表 如果我想添加更多节点，我必须在开始时使用 pos 字典设置它们的位置。

如何使用 add_node() 将节点添加到特定位置 x 和 y 的图形中

【参考方案1】：

您可以使用以下方法设置单个节点位置，然后提取“pos”字典以在绘图时使用。

In [1]: import networkx as nx

In [2]: G=nx.Graph()

In [3]: G.add_node(1,pos=(1,1))

In [4]: G.add_node(2,pos=(2,2))

In [5]: G.add_edge(1,2)

In [6]: pos=nx.get_node_attributes(G,'pos')

In [7]: pos
Out[7]: 1: (1, 1), 2: (2, 2)

In [8]: nx.draw(G,pos)

更新

添加绘图

【参考方案2】：

我不完全确定您想要完成什么，但我认为您想将节点添加到图表中，将它们绘制在想要的位置，并且仍然能够在图表对象中访问它们。

由于您没有将节点添加到图表中，这将是一个开始：

X.add_nodes_from(pos.keys())

那么你在绘制图形的时候就不用指定节点列表，这样你在添加新节点的时候就不用在两个不同的地方改变代码了。

如果您希望节点的位置作为节点属性，您也可以这样做：

for n, p in pos.iteritems():
    X.nodes[n]['pos'] = p

请注意，这些位置不会用作绘制图形时的位置，必须明确设置。然后，您可以使用以下命令绘制和显示图表：

nx.draw(X, pos)
plt.show()

假设您进行了导入 from matplotlib import pyplot as plt。

【讨论】：

并且需要明确的是，在 pos 中指定的位置与传递给 axes.scatter 的 (x,y) 坐标相同，所以它就像向右 x 和向上 y。

非常有帮助的答案，非常感谢！是否有来自networkx的函数来计算两个节点之间的euklidic距离？

@fuuman 我可能迟到了，但据我所知，没有直接的函数可以计算两个节点之间的欧几里得距离。作为参考，您可以使用不久前给我的这个答案：***.com/questions/36330642/…

pos 应该是一个字典吗？我想使用二维数组作为位置。有可能吗？

我使用的是 Networkx 2.5，是的，有可能。它等效于字典i:v for i,v in enumerate(pos) 和IndexError，以防range(len(pos)) 中存在X.nodes() 中不存在的索引。因此，这仅在 X.nodes() 是 range(len(pos)) 中的数字时才可用