Seaborn:带有频率的计数图()

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【中文标题】Seaborn:带有频率的计数图()【英文标题】:Seaborn: countplot() with frequencies 【发布时间】:2016-01-15 17:12:10 【问题描述】:

我有一个 Pandas DataFrame,其中有一列名为“AXLES”,它可以取 3-12 之间的整数值。我正在尝试使用 Seaborn 的 countplot() 选项来实现以下情节:

    左 y 轴显示这些值在数据中出现的频率。轴延伸为 [0%-100%],每 10% 处有刻度线。 右 y 轴显示实际计数,值对应于左 y 轴确定的刻度线(每 10% 标记一次。) x 轴显示条形图的类别 [3、4、5、6、7、8、9、10、11、12]。 条形顶部的注释显示该类别的实际百分比。

以下代码为我提供了下面的图,其中包含实际计数,但我找不到将它们转换为频率的方法。我可以使用 df.AXLES.value_counts()/len(df.index) 获取频率,但我不确定如何将此信息插入 Seaborn 的 countplot()

我还找到了注释的解决方法,但我不确定这是否是最好的实现。

任何帮助将不胜感激!

谢谢

plt.figure(figsize=(12,8))
ax = sns.countplot(x="AXLES", data=dfWIM, order=[3,4,5,6,7,8,9,10,11,12])
plt.title('Distribution of Truck Configurations')
plt.xlabel('Number of Axles')
plt.ylabel('Frequency [%]')

for p in ax.patches:
        ax.annotate('%:.1f'.format(p.get_height()), (p.get_x()+0.1, p.get_height()+50))

编辑:

使用 Pandas 的条形图,抛弃 Seaborn,我更接近于我需要的代码。感觉就像我使用了很多解决方法,并且必须有一种更简单的方法来做到这一点。这种方法的问题:

Pandas 的条形图函数中没有 order 关键字,因为 Seaborn 的 countplot() 有,所以我不能像在 countplot() 中那样绘制 3-12 的所有类别。即使该类别中没有数据,我也需要显示它们。

辅助 y 轴由于某种原因弄乱了条形和注释(请参阅在文本和条形上绘制的白色网格线)。

plt.figure(figsize=(12,8))
plt.title('Distribution of Truck Configurations')
plt.xlabel('Number of Axles')
plt.ylabel('Frequency [%]')

ax = (dfWIM.AXLES.value_counts()/len(df)*100).sort_index().plot(kind="bar", rot=0)
ax.set_yticks(np.arange(0, 110, 10))

ax2 = ax.twinx()
ax2.set_yticks(np.arange(0, 110, 10)*len(df)/100)

for p in ax.patches:
    ax.annotate(':.2f%'.format(p.get_height()), (p.get_x()+0.15, p.get_height()+1))

【问题讨论】:

为什么不将刻度标签除以总数来获得频率? 我尝试使用vals = ax.get_yticks()ax.set_yticks(vals/len(df))。但是,一旦我这样做了,由于绘图的实际 y 比例,所有标签最终都位于原点附近的最底部。显然我的方法是错误的。你会怎么做? 你救了我的命 :D :D :D 【参考方案1】:

您可以通过为频率创建一个twinx 轴来做到这一点。您可以切换两个 y 轴,使频率保持在左侧,计数保持在右侧,但无需重新计算计数轴(这里我们使用 tick_left()tick_right() 移动刻度,set_label_position 移动到移动轴标签

然后您可以使用matplotlib.ticker 模块设置刻度,特别是ticker.MultipleLocatorticker.LinearLocator

至于您的注释,您可以使用patch.get_bbox().get_points() 获取条形图所有 4 个角的 x 和 y 位置。这与正确设置水平和垂直对齐方式一起,意味着您无需向注释位置添加任何任意偏移量。

最后,您需要关闭孪生轴的网格,以防止网格线出现在条形顶部 (ax2.grid(None))

这是一个工作脚本:

import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
import matplotlib.ticker as ticker

# Some random data
dfWIM = pd.DataFrame('AXLES': np.random.normal(8, 2, 5000).astype(int))
ncount = len(dfWIM)

plt.figure(figsize=(12,8))
ax = sns.countplot(x="AXLES", data=dfWIM, order=[3,4,5,6,7,8,9,10,11,12])
plt.title('Distribution of Truck Configurations')
plt.xlabel('Number of Axles')

# Make twin axis
ax2=ax.twinx()

# Switch so count axis is on right, frequency on left
ax2.yaxis.tick_left()
ax.yaxis.tick_right()

# Also switch the labels over
ax.yaxis.set_label_position('right')
ax2.yaxis.set_label_position('left')

ax2.set_ylabel('Frequency [%]')

for p in ax.patches:
    x=p.get_bbox().get_points()[:,0]
    y=p.get_bbox().get_points()[1,1]
    ax.annotate(':.1f%'.format(100.*y/ncount), (x.mean(), y), 
            ha='center', va='bottom') # set the alignment of the text

# Use a LinearLocator to ensure the correct number of ticks
ax.yaxis.set_major_locator(ticker.LinearLocator(11))

# Fix the frequency range to 0-100
ax2.set_ylim(0,100)
ax.set_ylim(0,ncount)

# And use a MultipleLocator to ensure a tick spacing of 10
ax2.yaxis.set_major_locator(ticker.MultipleLocator(10))

# Need to turn the grid on ax2 off, otherwise the gridlines end up on top of the bars
ax2.grid(None)

plt.savefig('snscounter.pdf')

【讨论】:

谢谢!避免“扁平化”直方图的一种可能改进:# Fix the frequency range to 0-100 without changing axes zoom:ax2.set_ylim(0,100*ax.get_ylim()[1]/ncount)【参考方案2】:

我使用核心 matplotlib 的条形图让它工作。我显然没有您的数据,但将其适应您的数据应该是直截了当的。

方法

我使用matplotlib 的双轴并将数据绘制为第二个Axes 对象上的条形图。其余的只是一些摆弄以正确地标记刻度并进行注释。

希望这会有所帮助。

代码

import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import seaborn as sns

tot = np.random.rand( 1 ) * 100
data = np.random.rand( 1, 12 )
data = data / sum(data,1) * tot

df = pd.DataFrame( data )
palette = sns.husl_palette(9, s=0.7 )

### Left Axis
# Plot nothing here, autmatically scales to second axis.

fig, ax1 = plt.subplots()
ax1.set_ylim( [0,100] )

# Remove grid lines.
ax1.grid( False )
# Set ticks and add percentage sign.
ax1.yaxis.set_ticks( np.arange(0,101,10) )
fmt = '%.0f%%'
yticks = matplotlib.ticker.FormatStrFormatter( fmt )
ax1.yaxis.set_major_formatter( yticks )

### Right Axis
# Plot data as bars.
x = np.arange(0,9,1)
ax2 = ax1.twinx()
rects = ax2.bar( x-0.4, np.asarray(df.loc[0,3:]), width=0.8 )

# Set ticks on x-axis and remove grid lines.
ax2.set_xlim( [-0.5,8.5] )
ax2.xaxis.set_ticks( x )
ax2.xaxis.grid( False )

# Set ticks on y-axis in 10% steps.
ax2.set_ylim( [0,tot] )
ax2.yaxis.set_ticks( np.linspace( 0, tot, 11 ) )

# Add labels and change colors.
for i,r in enumerate(rects):
    h = r.get_height()
    r.set_color( palette[ i % len(palette) ] )
    ax2.text( r.get_x() + r.get_width()/2.0, \
              h + 0.01*tot,                  \
              r'%d%%'%int(100*h/tot), ha = 'center' )

【讨论】:

【参考方案3】:

我觉得你可以先手动设置y大刻度,然后修改每个标签

dfWIM = pd.DataFrame('AXLES': np.random.randint(3, 10, 1000))
total = len(dfWIM)*1.
plt.figure(figsize=(12,8))
ax = sns.countplot(x="AXLES", data=dfWIM, order=[3,4,5,6,7,8,9,10,11,12])
plt.title('Distribution of Truck Configurations')
plt.xlabel('Number of Axles')
plt.ylabel('Frequency [%]')

for p in ax.patches:
        ax.annotate(':.1f%'.format(100*p.get_height()/total), (p.get_x()+0.1, p.get_height()+5))

#put 11 ticks (therefore 10 steps), from 0 to the total number of rows in the dataframe
ax.yaxis.set_ticks(np.linspace(0, total, 11))

#adjust the ticklabel to the desired format, without changing the position of the ticks. 
_ = ax.set_yticklabels(map(':.1f%'.format, 100*ax.yaxis.get_majorticklocs()/total))

【讨论】:

以上是关于Seaborn:带有频率的计数图()的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

如何在 seaborn 中并排绘制两个计数图?

Seaborn FacetGrid 用于分层计数图?

如何缩放具有不同频率的多个KDE图?

如何在使用“融化”分组的seaborn计数图上获得高于柱的值

位于子图中的多个计数图中的Seaborn堆叠条[重复]

如何更改 seaborn countplot 中图例的位置?