带有调整 p 值的 R 的 Kruskal-Wallis 检验

Posted 2023-02-16

【中文标题】带有调整 p 值的 R 的 Kruskal-Wallis 检验

【英文标题】：Kruskal-Wallis Test on R with ajusted p-value

【发布时间】：2019-06-14 23:52:11

【问题描述】：

我正在对我的数据集执行 Kruskal-Wallis 测试，我正在尝试调整 p 值，但它似乎不起作用，这是我的代码：

> kruskal.test(df$Folate_biosynthesis, df$Group, p.adj="holm")

        Kruskal-Wallis rank sum test

data:  df$Folate_biosynthesis and df$Group Kruskal-Wallis chi-squared
= 8.5144, df = 5, p-value = 0.1301

> kruskal.test(df$Folate_biosynthesis, df$Group, p.adj="none")

        Kruskal-Wallis rank sum test

data:  df$Folate_biosynthesis and df$Group Kruskal-Wallis chi-squared
= 8.5144, df = 5, p-value = 0.1301

如您所见，如果我输入p.adjust = "none"，我得到的结果完全相同。怎么可能？ 在此先感谢所有愿意提供帮助的人。 安德烈亚

【问题讨论】：

P 值调整通常在您有多个 p 值时进行。您只有一个 p 值，所以我想知道您希望调整在这里做什么。

【参考方案1】：

当您有多个 p 值时，通常会进行 P 值调整。您只有一个 p 值，所以我想知道您希望在这里进行什么调整。

话虽如此，kruskal.test 也没有出现p.adj 参数。该函数有一个点参数，但据我所知，它不会使用或将这些参数传递给任何其他函数，因此任何不是命名参数的输入基本上都将被忽略。

如果您想调整来自 kruskal.test 的多个输出的 p 值，您可以将 p 值收集到一个向量中，然后使用适当的方法将它们直接传递给 p.adjust。

但话虽如此，尚不清楚您希望实现什么 - 但很明显，尝试在 kruskal.test 中使用 p.adj 参数并不是实现目标的方法。