Python networkx：边缘收缩

Posted 2023-02-19

【中文标题】Python networkx：边缘收缩

【英文标题】：Python networkx : edge contraction

【发布时间】：2013-03-16 11:29:25

【问题描述】：

我有一个NetworkX 图表。我想知道如何在多个节点之间做edge contraction。

例如，如果我想收缩 X、Y 和 Z：

         _ node A _
       _/    |     \_
node X --- node Y --- node Z

会变成

           node A 
             |     
           node XYZ (or whatever X/Y/Z)

图表创建不是问题。有用。我想通过合并具有相同“含义”的节点来缩小图形：我称之为“end lvl”（节点名称长度等于 7）并且链接在一起的节点。

我在NetworkX中找到了冷凝功能，所以我尝试使用它：

# edge contraction for same nodes
# for each node, get the links to other nodes "end lvl"
# if there is such a link, it means that these node are
# the sames
#
# copy graph
I = G
for n,d in G.nodes(data=True):
    if n in I.nodes():
        if len(n) == 7:
            # list of nodes adjacent to n : filter only "end lvl" nodes
            neighbors = [ node for node in I.neighbors(n) if len(node) == 7 ]
            nodes_to_merges = neighbors.append(n)
            I = nx.condensation(I,scc=nodes_to_merges)

我转换成 JSON 的时候得到的是：

"directed": true, "graph": [], "nodes": ["id": 0], "links": [], "multigraph": false

如您所见，有一个问题......

对函数的引用是here。

【问题讨论】：

一种解决方案是使用 dict 表示 (to_dict_of_dicts) 手动完成。

好吧，我不熟悉图表，但我应该改进我的问题，正如@zodiac 所问的那样。来了。

nodes()、neighbours() 和condensation() 函数有什么作用？ nx 是什么？

nx 是 python networkx ：networkx.github.com。 Nodes() 返回图的节点。 Neighbors(x) 返回节点 x 的邻居节点。 G 的凝聚是每个强连接的组件或节点都收缩为单个节点的图。

你的整个图似乎与我有很强的联系，因此输出只有一个节点。不要用它来收缩任意节点

【参考方案1】：

怎么样：

add_node(XYZ)
add_edge(XYZ, A)
for edge incident on (X, Y, Z):
    v = nodes in edge not in (X, Y, Z, A)
    if v:
       remove_edge(edge)
       add_edge(v, XYZ)
for node in (X, Y, Z):
    remove_node(node)

【讨论】：

我用 python 和 networkx 函数重写了你的伪代码。我做了我想要的。谢谢。

请注意，以上将擦除边缘和节点的任何属性信息。

【参考方案2】：

不要尝试使用 nx.condensation（用于收缩强连接组件，而不是一般的节点组），而是使用以下函数：

http://networkx.readthedocs.io/en/stable/reference/classes.graph.html#adding-and-removing-nodes-and-edges

删除除一个折叠节点之外的所有节点并重新连接它们的节点。

【讨论】：

网络不存在