“这是一个 distutils 安装的项目......”调用 install_mlflow() 时

Posted 2023-02-14

【中文标题】“这是一个 distutils 安装的项目......”调用 install_mlflow() 时

【英文标题】："It is a distutils installed project ..." when calling install_mlflow()

【发布时间】：2021-12-29 22:23:17

【问题描述】：

当调用install_mlflow()为R安装mlflow时，遇到如下错误。

尝试卸载：证书 找到现有安装：certifi 2018.4.16 错误：无法卸载“证书”。这是一个 distutils 安装的项目，因此我们无法准确确定哪些文件属于它，这只会导致部分卸载。

注意：以上是使用miniconda使用install_miniconda()命令安装的。

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附：为了大家的利益发布问题和答案（我花了 2 天时间）。

【参考方案1】：

根本原因：

函数install_mlflow()调用reticulate::conda_install()函数，默认值为pip_ignore_installed，结果是FALSE。

? 提示：按住 cmd 键的同时点击脚本中的任意函数即可查看源代码。

解决方法：

您可以通过使用pip_ignore_installed = TRUE 调用函数来解决此问题。为方便起见，我在下面的脚本中重新创建了 install_mlflow() 函数。

如果未安装，该脚本还会检查并安装miniconda。

library(reticulate)
library(mlflow)


# Installing minicoda if not installed
if (!dir.exists(miniconda_path()))
  install_miniconda(path = miniconda_path(), update = TRUE, force = TRUE)

# install_mlflow() # This doesn't work so we use the alt fn below.
install_mlflow_alt <- function() 
  mlflow_version <- utils::packageVersion("mlflow")
  packages <- c(paste("mlflow", "==", mlflow_version, sep = ""))
  # Geting mlflow conda bin
  conda_home <- Sys.getenv("MLFLOW_CONDA_HOME", NA)
  conda <- if (!is.na(conda_home)) 
    paste(conda_home, "bin", "conda", sep = "/")
   else 
    "auto"
  
  conda_try <- try(conda_binary(conda = conda), silent = TRUE)
  if (class(conda_try) == "try-error") 
    msg <- paste(attributes(conda_try)$condition$message, 
                 paste("  If you are not using conda, you can set the environment variable", 
                       "MLFLOW_PYTHON_BIN to the path of your python executable."), 
                 sep = "\n")
    stop(msg)
  
  conda <- conda_try
  # Installing mlflow
  mlflow_conda_env_name <- paste("r-mlflow", mlflow_version, sep = "-")
  conda_install(packages, envname = mlflow_conda_env_name, 
                pip = TRUE, conda = conda, pip_ignore_installed = TRUE)


# NOTE: Run the following command in terminal (use pip3 for python 3)
#       before calling the install_mlflow_alt() function below
# paste("pip install -U mlflow==", mlflow:::mlflow_version(), sep="")
install_mlflow_alt()