mysql中的Sample-Gene-Expression数据存储问题

Posted 2023-05-08

【中文标题】mysql中的Sample-Gene-Expression数据存储问题

【英文标题】：Sample-Gene-Expression data storage problem in mysql

【发布时间】：2019-07-17 09:38:21

【问题描述】：

我有 50 gb 样本基因表达数据。我想将这些数据存储在 mysql 文件中。数据分为三个 txt 文件。一个是样本，第二个是基因，第三个是一个样本基因矩阵，存储它们的表达式值。

我尝试了三个表，一个是样本，第二个是基因，第三个是两个外键样本 id、geneid 和字段 exp_value。但问题是我如何将该矩阵存储在此表中。

【问题讨论】：

@Michael Andrew Bentley :- 我认为你解决了这类问题。你能帮我解决这个问题吗？

【参考方案1】：

请阅读 https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/load-data.html

您有文本文件中的数据，希望它已经用分隔符格式化。如果已格式化，则很容易导入。

如果您使用的是 linux，请使用 Konsole。如果您使用的是 Windows，请使用 CMD。为这么大的文件大小导入它需要一段时间。你只需要等待。一开始会有很多试验和错误。

【讨论】：

非常感谢...我会试试这个。