尝试在另一台计算机上使用 glm 模型进行预测时出错

Posted 2023-05-07

【中文标题】尝试在另一台计算机上使用 glm 模型进行预测时出错

【英文标题】：An error while trying to use glm model for prediction on another computer

【发布时间】：2015-02-17 08:44:55

【问题描述】：

我想在一台 R 机器中保存一个 glm 对象，并将其用于预测位于另一台具有较新数据的机器上的另一个数据集。我尝试使用 save 和 load 但没有成功。我究竟做错了什么？ 这是一个玩具示例：

# on machine 1:
glm<-glm(y~x1+x2,data=dat1, family=binomial(link="logit")
save(glm,file="glm.Rdata") # the file is stored in a folder.

# on machine 2:
load(glm.RData) # got an error:"Error in load(glm.RData) : object 'glm.RData' not found"
#I tried :
 load(file='glm.RData') # no error was displayed
  print(glm) # got an error:"Error in load(glm.RData) : object 'glm.RData' not found"

任何帮助都会很棒。

【问题讨论】：

您在正确的工作区吗？您可以使用load(file.choose()) 导航到正确的文件。

你可能想看看?getwd和?setwd。

我关注了@Pascal cmets，我看到glm文件的大小是0.5GB。不应该是只包含公式的小fie吗？

str(glm) 将让您一睹里面存储的内容。我会避免 glm 作为名称，因为它是函数本身。

我加载了文件，它工作正常！谢谢你的帮助。但是我真的不明白是否有办法只保存模型的论坛而不是整个数据集？

【参考方案1】：

根据@user3710546 的建议，我会避免使用名称glm 保存您的模型，因为它会屏蔽（即阻止）glm() 函数，使您难以在会话中使用它。

使用save() 和load()

save() 通常用于将对象的列表 保存到文件中，而不是单个对象。 save() 的第一个参数是 list，“包含要保存的对象的名称 的字符向量。” （强调我的。）所以你想这样使用它：

# On machine 1:
save(list = 'glm', file = '/path/to/glm.RData')

# On machine 2:
load(file = '/path/to/glm.RData')

请注意，文件扩展名通常区分大小写：您保存到扩展名为 .RData 的文件中，但从扩展名为 .Rdata 的文件加载，这是不同的。这可以解释为什么找不到文件。

使用saveRDS() 和readRDS()

使用save() 和load 的另一种方法是使用saveRDS() 和readRDS()，它们被设计用于一个对象。它们的用法略有不同：

# On machine 1
saveRDS(glm, file = '/path/to/glm.rds')

# On machine 2
glm = readRDS(file = '/path/to/glm.rds')

注意.rds 文件扩展名以及readRDS() 不会自动放入环境中的事实（它需要分配给某些东西）。

保存部分 GLM

如果您只想保存公式（即实际文本字符串），您可以在glm$formula 中找到它，其中glm 是您的对象名称。它以formula 对象的形式返回，但您可以使用as.character(glm$formula) 将其转换为字符串，然后写入文本文件或其他文件。

但是，如果您希望模型本身 没有创建它的数据集（以减少磁盘空间），请查看 this article，其中讨论了 @ 的哪些部分987654349@对象可以安全删除。