R保存data.frame每次迭代

Posted 2023-05-07

【中文标题】R保存data.frame每次迭代

【英文标题】：R save data.frame each iteration

【发布时间】：2014-07-28 21:40:08

【问题描述】：

我有一个用于构建数据框的循环，我想在每次迭代时将所有小片段写入 csv 文件。类似于rbind() 但在文件中...

我见过像这样的 sink()

示例：

sink("resultat/output.txt")
df.total<-NULL
for(i in 1:length(list2.1))
  if(i%%100==0)print(i)
  tps<-as.data.frame(list2.1[i])
  tps<-cbind(tps,as.data.frame(list2.2[i]))
  colnames(tps)<-c("slope","echange")
  tps$Run<-rep(data$run_nb[i],length(tps$slope))
  tps$coefSlope<-rep(data$coef_Slope_i[i],length(tps$slope))
  tps$coefDist<-rep(data$coef_dist_i[i],length(tps$slope))
  sink(tps)
  df.total<-rbind(df.total,tps)

sink()
write.csv(df.total,"resultat/df_total.csv")

但我认为它不适用于我的情况...... 任何建议

【问题讨论】：

考虑稍微修改一下您的问题。通过minimal example 向我们展示您的问题。您的示例太长，没有专注于您的问题，我们缺少数据。

【参考方案1】：

您可以使用 sink（将 R 输出重定向到连接）和 print

df <- data.frame(a = 0:1, b = 1:2)
sink("output.txt")
for(i in 1:10) 
    print(df[i+2, ] <- c(sum(df$a), tail(df$b, 1) + 1))
    ## Or, to save the whole data.frame each time: print(df)

sink()

另一种选择是使用cat

df <- data.frame(a = 0:1, b = 1:2)
for(i in 1:10) 
    cat(df[i+2, ] <- c(sum(df$a), tail(df$b, 1) + 1), "\n", file="output.txt" append=TRUE)

你也可以使用write.table来保存整个data.frame

df <- data.frame(a = 0:1, b = 1:2)
for(i in 1:10) 
    df[i+2, ] <- c(sum(df$a), tail(df$b, 1) + 1)
    write.table(df, file="output.txt", append=TRUE)

如果您设置append = FALSE，则只会保存最后一次迭代。

【讨论】：

谢谢write.table(df, file="output.txt", append=TRUE) 正是我所需要的