对 MongoDB 3 的 rmongodb 支持

Posted 2023-04-18

【中文标题】对 MongoDB 3 的 rmongodb 支持

【英文标题】：rmongodb support for MongoDB 3

【发布时间】：2015-06-26 04:54:20

【问题描述】：

我正在构建一个 R 脚本，我需要在其中通过身份验证连接到 MongoDB 并使用 rmongodb 处理从数据库中获取的数据> 包。为此，我在 3.0.4 版 中创建了一个新的 MongoDB 用户，并且从 R 脚本 连接到 mongoDB 身份验证失败。 此外，用户通过 mongo shell 成功验证。 当我对在 MongoDB 版本 2.x 中创建的用户进行身份验证时，身份验证也可以正常工作。

以下是我们在 R 脚本中用于连接 Mongo 数据库的代码 sn-p。

mongo

在执行上述代码 sn-p 时，我们收到以下响应

错误：加载所需的包：rmongodb 身份验证失败。

请建议我解决 rmongodb 包中身份验证失败问题的适当解决方案。

【问题讨论】：

向我们展示您用于连接 MongoDB 的代码和错误消息（如果需要，请隐藏密码）。

@Spacedman 我已经包含了有问题的代码 sn-p 和错误消息

【参考方案1】：

rmongodb（截至 1.8.0）使用旧版 MongoDB C 驱动程序，该驱动程序尚不完全支持 MongoDB 3.0。特别是，它不支持使用新的 SCRAM-SHA-1 默认身份验证或可选的 WiredTiger 存储引擎。

Github 中有一个 rmongodb 问题跟踪此问题：Compatibility with version 3.0 of MongoDB。

在rmongodb 更新之前，您的选项（按照麻烦最少到最多的顺序）包括：

使用支持 MongoDB 3.x 的不同驱动程序（即RMongo 0.1.0 or newer）

使用 MongoDB 2.6

使用 MongoDB 3.x 但降级到较旧的 MONGO-CR 身份验证（并且不要使用 WiredTiger 或任何替代存储引擎）

【讨论】：

注：看起来 RMongo 0.1.0 还没有登陆 CRAN，所以你可能需要从 github 上的 master 分支构建包。

我已将 MongoDB 3 配置为支持 MONGODB-CR 身份验证，因此用户已成功通过身份验证，R 脚本也能够使用 WiredTiger 存储引擎访问集合

@RubinPorwal 很高兴听到你成功了！除了身份验证之外，在 MongoDB 3.0 中使用较旧驱动程序的主要问题是，如果您的服务器使用的是 WiredTiger 等非默认存储引擎，则无法列出集合或索引。驱动程序需要实现新的listCollections 和listIndexes 服务器命令。

【参考方案2】：

我自己刚刚经历了这个，我想我会加两分钱，以防它对某人有帮助。

@Stennie 正是针对身份验证的目标。因此，如果您想使用 mongo 3，其运行方式如下（这是来自 ubuntu 安装）。

1) sudo nano /etc/mongod.conf 2) Comment out the "auth=TRUE" line 3) sudo service mongod restart 4) login to mongo shell (now with no authentication so everything is open) 5) use admin 6) Execute the following: var schema = db.system.version.findOne("_id" : "authSchema") schema.currentVersion = 3 db.system.version.save(schema) (the above 3 commands are from here: https://jira.mongodb.org/browse/SERVER-17459) 7) create your users in the appropriate database 8) to make sure the right credentials are set up, type db.system.users.find() and amke sure they have the MONGODB-CR credentials 9) quit mongo 10) ucomment out the authentication line in /etc/mongod.conf 11) restart mongodb using sudo service mongod restart

现在应该可以工作了！我希望对某人有所帮助...