在 Pandas GroupBy 数据框中按 ID 计算两个日期之间的行数

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【中文标题】在 Pandas GroupBy 数据框中按 ID 计算两个日期之间的行数【英文标题】:Count Number of Rows Between Two Dates BY ID in a Pandas GroupBy Dataframe 【发布时间】:2015-10-24 17:00:09 【问题描述】:

我有以下测试数据框:

import random
from datetime import timedelta
import pandas as pd
import datetime

#create test range of dates
rng=pd.date_range(datetime.date(2015,1,1),datetime.date(2015,7,31))
rnglist=rng.tolist()
testpts = range(100,121)
#create test dataframe
d='jid':[i for i in range(100,121)], 'cid':[random.randint(1,2) for _ in testpts],
    'stdt':[rnglist[random.randint(0,len(rng))] for _ in testpts]
df=pd.DataFrame(d)
df['enddt'] = df['stdt']+timedelta(days=random.randint(2,32))

它给出了如下所示的数据框,其中包含公司 ID 列“cid”、唯一 ID 列“jid”、开始日期“stdt”和结束日期“enddt”。

   cid  jid       stdt      enddt
0    1  100 2015-07-06 2015-07-13
1    1  101 2015-07-15 2015-07-22
2    2  102 2015-07-12 2015-07-19
3    2  103 2015-07-07 2015-07-14
4    2  104 2015-07-14 2015-07-21
5    1  105 2015-07-11 2015-07-18
6    1  106 2015-07-12 2015-07-19
7    2  107 2015-07-01 2015-07-08
8    2  108 2015-07-10 2015-07-17
9    2  109 2015-07-09 2015-07-16

我需要做的是以下几点:计算 cid 发生的 jid 数,对于 min(stdt) 之间的每个 date(newdate) 和 max(enddt),其中 newdate 在 stdt 和 结束。

生成的数据集应该是一个数据框,其中包含每个 cid、每个 cid 特定的 min(stdt) 和 max(enddt) 之间的日期列范围 (newdate) 和计数 (cnt) newdate 介于 min(stdt) 和 max(enddt) 之间的 jid 数。生成的 DataFrame 应该看起来像(这仅适用于使用上述数据的 1 个 cid):

cid newdate cnt
1   2015-07-06  1
1   2015-07-07  1
1   2015-07-08  1
1   2015-07-09  1
1   2015-07-10  1
1   2015-07-11  2
1   2015-07-12  3
1   2015-07-13  3
1   2015-07-14  2
1   2015-07-15  3
1   2015-07-16  3
1   2015-07-17  3
1   2015-07-18  3
1   2015-07-19  2
1   2015-07-20  1
1   2015-07-21  1
1   2015-07-22  1

我相信应该有一种方法可以使用 pandas groupby (groupby cid) 和某种形式的 lambda(?) 来以 Python 方式创建这个新的数据框。

我目前为每个 cid 运行一个循环(我将 cid 行从主 df 中切出),在循环中确定相关的日期范围(每个 cid 帧的 min stdt 和 max enddt,然后是每个 newdates (range mindate-maxdate) 它计算新日期在每个 jid 的 stdt 和 enddt 之间的 jid 的数量。然后我将每个结果数据集附加到一个新的数据帧中,如下所示。

但是从资源和时间的角度来看,这是非常昂贵的。为数以千计的 cid 对数百万个 jid 执行此操作实际上需要一整天。我希望这里有一个简单的(r)熊猫解决方案。

【问题讨论】:

【参考方案1】:

对于这些问题,我通常的方法是根据改变累加器的事件来进行调整和思考。我们看到的每个新“stdt”都会在计数中增加 +1;我们看到的每个“enddt”都会增加-1。 (第二天加上-1,至少如果我解释“介于”你的方式的话。有些日子我认为我们应该禁止使用这个词太模棱两可..)

IOW,如果我们把你的框架变成类似的东西

>>> df.head()
    cid  jid  change       date
0     1  100       1 2015-01-06
1     1  101       1 2015-01-07
21    1  100      -1 2015-01-16
22    1  101      -1 2015-01-17
17    1  117       1 2015-03-01

那么我们想要的只是change 的累积和(经过适当的重组)。例如,像

df["enddt"] += timedelta(days=1)
df = pd.melt(df, id_vars=["cid", "jid"], var_name="change", value_name="date")
df["change"] = df["change"].replace("stdt": 1, "enddt": -1)
df = df.sort(["cid", "date"])

df = df.groupby(["cid", "date"],as_index=False)["change"].sum()
df["count"] = df.groupby("cid")["change"].cumsum()

new_time = pd.date_range(df.date.min(), df.date.max())

df_parts = []
for cid, group in df.groupby("cid"):
    full_count = group[["date", "count"]].set_index("date")
    full_count = full_count.reindex(new_time)
    full_count = full_count.ffill().fillna(0)
    full_count["cid"] = cid
    df_parts.append(full_count)

df_new = pd.concat(df_parts)

这给了我类似的东西

>>> df_new.head(15)
            count  cid
2015-01-03      0    1
2015-01-04      0    1
2015-01-05      0    1
2015-01-06      1    1
2015-01-07      2    1
2015-01-08      2    1
2015-01-09      2    1
2015-01-10      2    1
2015-01-11      2    1
2015-01-12      2    1
2015-01-13      2    1
2015-01-14      2    1
2015-01-15      2    1
2015-01-16      1    1
2015-01-17      0    1

您的期望可能会有所不同;您可能对如何在同一时间窗口中处理多个重叠的jids 有不同的想法(这里它们计为 2);但即使您必须调整细节,使用事件的基本思想也应该证明是有用的。

【讨论】:

我喜欢这种方法。我现在要玩它,然后再回来看看。谢谢@DSM... 这非常有效。按照建议做了一些调整。 new_time 需要包含在循环中,以便为每个 cid 创建唯一的 stdt、enddt 时间索引日期。如果可以使用pd.melt,我会+10。多么棒的功能...谢谢@DSM... lg【参考方案2】:

这是我想出的一个解决方案(这将遍历唯一 cid 和日期范围的排列以获取您的计数):

from itertools import product
df_new_date=pd.DataFrame(list(product(df.cid.unique(),pd.date_range(df.stdt.min(), df.enddt.max()))),columns=['cid','newdate'])
df_new_date['cnt']=df_new_date.apply(lambda row:df[(df['cid']==row['cid'])&(df['stdt']<=row['newdate'])&(df['enddt']>=row['newdate'])]['jid'].count(),axis=1)

>>> df_new_date.head(20) 
    cid    newdate  cnt
0     1 2015-07-01    0
1     1 2015-07-02    0
2     1 2015-07-03    0
3     1 2015-07-04    0
4     1 2015-07-05    0
5     1 2015-07-06    1
6     1 2015-07-07    1
7     1 2015-07-08    1
8     1 2015-07-09    1
9     1 2015-07-10    1
10    1 2015-07-11    2
11    1 2015-07-12    3
12    1 2015-07-13    3
13    1 2015-07-14    2
14    1 2015-07-15    3
15    1 2015-07-16    3
16    1 2015-07-17    3
17    1 2015-07-18    3
18    1 2015-07-19    2
19    1 2015-07-20    1

如果您不想要零,您可以删除它们。不过,我认为这不会比您原来的解决方案好多少。

我建议您对@DSM 解决方案提供的循环使用以下改进:

df_parts=[]
for cid in df.cid.unique():
    full_count=df[(df.cid==cid)][['cid','date','count']].set_index("date").asfreq("D", method='ffill')[['cid','count']].reset_index()
    df_parts.append(full_count[full_count['count']!=0])

df_new = pd.concat(df_parts)

>>> df_new
         date  cid  count
0  2015-07-06    1      1
1  2015-07-07    1      1
2  2015-07-08    1      1
3  2015-07-09    1      1
4  2015-07-10    1      1
5  2015-07-11    1      2
6  2015-07-12    1      3
7  2015-07-13    1      3
8  2015-07-14    1      2
9  2015-07-15    1      3
10 2015-07-16    1      3
11 2015-07-17    1      3
12 2015-07-18    1      3
13 2015-07-19    1      2
14 2015-07-20    1      1
15 2015-07-21    1      1
16 2015-07-22    1      1
0  2015-07-01    2      1
1  2015-07-02    2      1
2  2015-07-03    2      1
3  2015-07-04    2      1
4  2015-07-05    2      1
5  2015-07-06    2      1
6  2015-07-07    2      2
7  2015-07-08    2      2
8  2015-07-09    2      2
9  2015-07-10    2      3
10 2015-07-11    2      3
11 2015-07-12    2      4
12 2015-07-13    2      4
13 2015-07-14    2      5
14 2015-07-15    2      4
15 2015-07-16    2      4
16 2015-07-17    2      3
17 2015-07-18    2      2
18 2015-07-19    2      2
19 2015-07-20    2      1
20 2015-07-21    2      1

对@DSM 提供的唯一真正改进是,这将避免需要为循环创建一个 groubby 对象,并且这还将为您提供每个 cid 数的所有 min stdt 和 max enddt 而没有零值。

【讨论】:

这也是一个很好的答案。我不确定哪一个在时间/记忆方面表现更好。当我获得更多声望点时,+ 会显示...非常 Pythonic 的解决方案!谢谢。

以上是关于在 Pandas GroupBy 数据框中按 ID 计算两个日期之间的行数的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

pandas 如何使用 groupby 在标签中按日期对列进行分组?

如何在 Pandas 数据框中按行值对日期时间列进行排序?

在 Pandas 数据框中按组过滤具有最小值的行 [重复]

将列的名称保留在 groupby 中,并在 pandas 数据框中使用 sum

带有 MultiIndexing 的 Pandas 数据框中的 Groupby

在 pandas 数据框中按组回归并添加带有预测值和 beta/t-stats 的列