无法编译 RcppArmadillo
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【中文标题】无法编译 RcppArmadillo【英文标题】：Cannot compile RcppArmadillo 【发布时间】：2020-11-02 20:21:54 【问题描述】：RcppArmadillo 是我尝试安装的几个软件包的依赖项。我在编译 RcppArmadillo 版本 0.10.1.0.0 时收到此错误（这是 R 在发现 RcppArmadillo 是一个 dep 时自动从 CRAN 中提取的内容）：
RcppArmadillo.cpp:26:40: error: redeclaration 'arma::arma_version::major' differs in 'constexpr'
const unsigned int arma::arma_version::major;
^
In file included from ../inst/include/armadillo:91:0,
from ../inst/include/RcppArmadilloForward.h:49,
from ../inst/include/RcppArmadillo.h:31,
from RcppArmadillo.cpp:22:
../inst/include/armadillo_bits/arma_version.hpp:31:33: error: from previous declaration 'arma::arma_version::major'
static constexpr unsigned int major = ARMA_VERSION_MAJOR;
^
RcppArmadillo.cpp:26:40: error: declaration of 'constexpr const unsigned int arma::arma_version::major' outside of class is not definition [-fpermissive]
const unsigned int arma::arma_version::major;
^
RcppArmadillo.cpp:27:40: error: redeclaration 'arma::arma_version::minor' differs in 'constexpr'
const unsigned int arma::arma_version::minor;
^
In file included from ../inst/include/armadillo:91:0,
from ../inst/include/RcppArmadilloForward.h:49,
from ../inst/include/RcppArmadillo.h:31,
from RcppArmadillo.cpp:22:
../inst/include/armadillo_bits/arma_version.hpp:32:33: error: from previous declaration 'arma::arma_version::minor'
static constexpr unsigned int minor = ARMA_VERSION_MINOR;
^
RcppArmadillo.cpp:27:40: error: declaration of 'constexpr const unsigned int arma::arma_version::minor' outside of class is not definition [-fpermissive]
const unsigned int arma::arma_version::minor;
^
RcppArmadillo.cpp:28:40: error: redeclaration 'arma::arma_version::patch' differs in 'constexpr'
const unsigned int arma::arma_version::patch;
^
In file included from ../inst/include/armadillo:91:0,
from ../inst/include/RcppArmadilloForward.h:49,
from ../inst/include/RcppArmadillo.h:31,
from RcppArmadillo.cpp:22:
../inst/include/armadillo_bits/arma_version.hpp:33:33: error: from previous declaration 'arma::arma_version::patch'
static constexpr unsigned int patch = ARMA_VERSION_PATCH;
^
RcppArmadillo.cpp:28:40: error: declaration of 'constexpr const unsigned int arma::arma_version::patch' outside of class is not definition [-fpermissive]
const unsigned int arma::arma_version::patch;
^
make: *** [RcppArmadillo.o] Error 1
make: *** Waiting for unfinished jobs....
ERROR: compilation failed for package 'RcppArmadillo'
* removing '/usr/local/lib64/R/library/RcppArmadillo'
* restoring previous '/usr/local/lib64/R/library/RcppArmadillo'
Error: Failed to install 'unknown package' from URL:
(converted from warning) installation of package 'RcppArmadillo' had non-zero exit status
Execution halted
FATAL: post proc: exit status 1
FATAL: While performing build: while running engine: exit status 255
这是在 R 3.6.0 中的 Singuarity 容器内构建的，在 CentOS 7 上使用 GCC 4.8.5。我可以使用 devtools 中的“install_version”命令安装 RcppArmadillo 的 0.9.900.3.0 版本（并且此版本在使用相同的其他软件包之前完全可以正常工作，这就是为什么我要安装它的原因），但是，每当我使用另一个软件包时，R 都会立即将其更新到版本 0.10.1.0.0我正在安装需要 RcppArmadillo 作为依赖项，这会导致上面的错误和我的构建失败。除了告诉它根本不为某些包安装依赖项之外，我还没有找到一种方法来阻止 R 这样做，但这让人头疼，我想看看这里是否有更简单的解决方案。有谁知道如何修复这个编译错误或如何防止 R 在安装另一个需要它的包时自动更新包？
这是显示在成功安装 RcppArmadillo 版本 0.9.900.3.0 后发生的更新的输出部分：
* DONE (RcppArmadillo)
Downloading package from url: https://ftp.osuosl.org/pub/cran/src/contrib/gratia_0.4.1.tar.gz
RcppArmad... (0.9.900.3.0 -> 0.10.1.0.0) [CRAN]
mvnfast (NA -> 0.2.5.1 ) [CRAN]
patchwork (NA -> 1.0.1 ) [CRAN]
Installing 3 packages: RcppArmadillo, mvnfast, patchwork
trying URL 'https://ftp.osuosl.org/pub/cran/src/contrib/RcppArmadillo_0.10.1.0.0.tar.gz'
【问题讨论】：
【参考方案1】：之前在 GitHub 存储库、邮件列表或此处已讨论过几次。
您最简单的选择是通过
选择更新版本install.packages("RcppArmadillo", repos="https://rcppcore.github.io/drat")
由于这不会影响 CRAN（或大多数用户）部署的任何系统，因此可能不值得重新上传（以及所有相关的麻烦）。如果您在这方面有选择权，您可能会考虑从 CentOS 7 继续。
【讨论】：
对不起 - 我不太明白。您所说的“由于这不会影响 CRAN（或大多数用户）部署的任何系统，因此可能不值得重新上传（以及所有相关的麻烦）。”是什么意思？新上传的内容是什么？这个编译问题不会影响大多数 CRAN 用户吗？ 每个 CRAN 包都有一个结果页面列出测试状态，RcppArmadillo it is here。它表明当前的 CRAN 版本“无处不在”。但是总有一些罕见的异常值，带有古老编译器的amd CentOS 7就是其中之一。我们有修复，它在我指给你的微版本中，它将在 next CRAN 版本中。我们现在根本不急于推出。 啊好吧，我明白了。有道理，谢谢你的信息！ 为了后代，相关的错误报告是here以上是关于无法编译 RcppArmadillo的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章