在 linux 中安装 matplotlib 的问题

Posted 2023-03-29

【中文标题】在 linux 中安装 matplotlib 的问题

【英文标题】：Problems installing matplotlib in linux

【发布时间】：2014-05-13 11:24:25

【问题描述】：

我已经成功安装了 numpy，我现在正在尝试安装 matplotlib。我正在按照以下网站上的步骤进行操作：

http://matplotlib.org/faq/installing_faq.html#source-install-from-git

执行以下命令后出现错误：

python setup.py install

这是错误：

Checking .pth file support in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/
error: can't create or remove files in install directory                                     '

The following error occurred while trying to add or remove files in the installation directory:

    [Errno 13] Permission denied: '/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/test-easy-install-24752.pth'

The installation directory you specified (via --install-dir, --prefix, or the distutils default setting) was:

    /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/

我在我的机器上以管理员身份工作，并且（我认为）拥有读/写文件的所有权限：

administrator@ubuntu:/usr/local/lib/python2.7/dist-packages$ ll -a
total 8
drwxrwsr-x 2 root staff 4096 Aug 20  2013 ./
drwxrwsr-x 4 root staff 4096 Mar  9 11:04 ../

有什么问题，我该如何解决？

【问题讨论】：

你可以尝试在 virtualenv 中工作 (virtualenv.readthedocs.org/en/latest)

@daouzli 在virtualenv 中安装matplotlib 相当棘手，因为后端依赖项通常需要在系统范围内安装。由于 OP 使用的是 Ubuntu，因此安装 matplotlib 的最简单方法可能就是 $ sudo apt-get install python-matplotlib。如果 OP 绝对有必要在 virtualenv 中从源代码构建它，那么 this guide 可能会有所帮助。

@ali_m sudo 命令确实起到了作用，谢谢。但是知道为什么即使我拥有所有足够的权限它也无法创建文件？

检查/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ 的权限——几乎可以肯定它只能由root 写入。以“管理员”身份登录通常意味着您在sudoers 列表中，但并不意味着您的普通登录 shell 可以写入系统文件（这是一件非常好的事情！）。一般来说，我强烈建议不要使用 sudo 安装 Python 包，使用 pip、easy_install 或 setup.py。您可能会陷入真正的混乱，因为其他包管理器（例如 apt-get）不知道以这种方式进行的任何更改。

@ali_m 请将其发布为答案。我倾向于使用混合系统来安装 mpl，gui-toolkit 的东西在安装的系统范围内（就像 BLAS 公司一样），我在 venv 中安装 mpl、np、scipy、ipython ……（使用系统包） .

【参考方案1】：

我在我的机器上以管理员身份工作，并且（我认为）拥有读/写文件的所有权限

这确实是一个更适合SuperUser 的讨论，但问题是成为“管理员”并不意味着你认为它会做什么。在这一行：

drwxrwsr-x 2 root staff 4096 Aug 20  2013 ./

root是目录的拥有者，最后的r-x表示其他用户只能读取和执行，不能写入这个目录（详见here）。

你能做什么？

以root 运行安装命令，例如$ sudo python setup.py install。这是不推荐！以这种方式安装系统范围的 Python 模块的问题是其他包管理器（例如apt-get）完全没有注意到以这种方式所做的任何更改，这往往会导致其他系统包的依赖关系混乱。

从 Ubuntu 存储库安装软件包，即$ sudo apt-get install python-matplotlib。这可能是安装 matplotlib 的最简单方法，并且不太可能破坏任何依赖项。但是，Ubuntu 存储库往往包含大多数 Python 软件包的较旧版本。

将其安装到virtualenv。这是安全的，因为它不会影响您的全局site-packages 中的任何内容，并且它允许您安装最新的前沿版本。但是，将 matplotlib 安装到 virtualenv 可能会很棘手，因为 matplotlib 有很多后端依赖项，通常需要在系统范围内安装。要解决此问题，您可以：

a) 使用 --system-site-packages 标志创建您的 virtualenv。使用此选项，如果 Python 尝试 import 一个未本地安装在您的 virutalenv 的 site-packages 目录中的模块，它将在系统范围内的 site-packages 中查找。这意味着您可以在 virtualenv 本地安装 matplotlib，它会在系统范围的 site-packages 中找到其所有后端依赖项。不利的一面是，如果您在本地和系统范围内都安装了相同的模块，则必须更加小心实际正在导入的版本。

b) 使用--no-site-packages 标志创建您的virtualenv，然后在系统范围的site-packages 目录中创建指向所需模块的符号链接。 This blog article 提供了一套很好的说明，用于使用符号链接在 virtualenv 中安装 matplotlib。这种方法比较棘手，但优点是您的 virtualenv （几乎！）完全独立，毫无疑问您的模块 imports 来自哪里。

【讨论】：

很好的答案。我可能会在不久的将来某个时候使用那个符号链接技巧。我想知道破解 venv 给它一个要使用的包列表有多难......

您的意思是自动生成指向系统站点包中特定目录的符号链接？使用 virtualenvwrapper，您可能可以在 post_mkvirtualenv 脚本中添加一些内容，前提是您确切知道需要链接的内容。

是的，我就是这么想的。我想要的主要用途是能够使用 pyside/pyqt/pygtk 的系统安装将科学 Python 堆栈放在虚拟环境中。

我也经常需要做这种事情，但到目前为止我还没有费心把脚本放在一起。 this 可能对 pyqt 方面有用。