sklearn RandomizedSearchCV 提取不同折叠的混淆矩阵
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【中文标题】sklearn RandomizedSearchCV 提取不同折叠的混淆矩阵【英文标题】:sklearn RandomizedSearchCV extract confusion matrix for different folds 【发布时间】:2018-02-05 12:02:48 【问题描述】:我尝试计算一个聚合混淆矩阵来评估我的模型:
cv_results = cross_validate(estimator, dataset.data, dataset.target, scoring=scoring,
cv=Config.CROSS_VALIDATION_FOLDS, n_jobs=N_CPUS, return_train_score=False)
但我不知道如何提取不同折叠的单个混淆矩阵。在得分手中我可以计算它:
scoring =
'cm': make_scorer(confusion_matrix)
,但我无法返回 comfusion 矩阵,因为它必须返回一个数字而不是数组。如果我尝试它,我会收到以下错误:
ValueError: scoring must return a number, got [[...]] (<class 'numpy.ndarray'>) instead. (scorer=cm)
我想知道是否可以将混淆矩阵存储在全局变量中,但使用没有成功
global cm_list
cm_list.append(confusion_matrix(y_true,y_pred))
在自定义记分器中。
提前感谢您的任何建议。
【问题讨论】:
如果下面的答案给了你所需的答案,你能接受它作为答案 【参考方案1】:要返回每个折叠的混淆矩阵,您可以在每次迭代(折叠)中从度量模块调用混淆矩阵,这将为您提供一个数组作为输出。输入将为每个折叠获得的 y_true 和 y_predict 值。
from sklearn import metrics
print metrics.confusion_matrix(y_true,y_predict)
array([[327582, 264313],
[167523, 686735]])
或者,如果您使用的是 pandas,那么 pandas 有一个交叉表模块
df_conf = pd.crosstab(y_true,y_predict,rownames=['Actual'],colnames=['Predicted'],margins=True)
print df_conf
Predicted 0 1 All
Actual
0 332553 58491 391044
1 97283 292623 389906
All 429836 351114 780950
【讨论】:
【参考方案2】:问题是,在 RandomizedSearchCV 完成后我无法访问估计器,因为我不知道 RandomizedSearchCV 实现了预测方法。这是我的个人解决方案:
r_search = RandomizedSearchCV(estimator=estimator, param_distributions=param_distributions,
n_iter=n_iter, cv=cv, scoring=scorer, n_jobs=n_cpus,
refit=next(iter(scorer)))
r_search.fit(X, y_true)
y_pred = r_search.predict(X)
cm = confusion_matrix(y_true, y_pred)
【讨论】:
这是否为您提供了 k 折叠中所有解决方案的混淆矩阵或仅其中一个? 在 fit() 方法中,您应该传递您的 x_train 和 y_train,而应使用 y_test 和 y_test pred 绘制混淆方法。你在混合东西。以上是关于sklearn RandomizedSearchCV 提取不同折叠的混淆矩阵的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章