无法在多标签分类器上使用 Stratified-K-Fold
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【中文标题】无法在多标签分类器上使用 Stratified-K-Fold【英文标题】:Not able to use Stratified-K-Fold on multi label classifier 【发布时间】:2019-07-20 07:33:13 【问题描述】:以下代码用于进行 KFold 验证,但我要在模型抛出错误时对其进行训练
ValueError: Error when checking target: expected dense_14 to have shape (7,) but got array with shape (1,)
我的目标变量有 7 个类。我正在使用LabelEncoder
将类编码为数字。
通过看到此错误,如果我将 MultiLabelBinarizer
更改为对类进行编码。我收到以下错误
ValueError: Supported target types are: ('binary', 'multiclass'). Got 'multilabel-indicator' instead.
以下是KFold验证的代码
skf = StratifiedKFold(n_splits=10, shuffle=True)
scores = np.zeros(10)
idx = 0
for index, (train_indices, val_indices) in enumerate(skf.split(X, y)):
print("Training on fold " + str(index+1) + "/10...")
# Generate batches from indices
xtrain, xval = X[train_indices], X[val_indices]
ytrain, yval = y[train_indices], y[val_indices]
model = None
model = load_model() //defined above
scores[idx] = train_model(model, xtrain, ytrain, xval, yval)
idx+=1
print(scores)
print(scores.mean())
我不知道该怎么办。我想在我的模型上使用分层 K 折叠。请帮帮我。
【问题讨论】:
【参考方案1】:MultiLabelBinarizer
返回一个与您的类数长度相同的向量。
如果您查看StratifiedKFold
splits 您的数据集,您会发现它只接受一维目标变量,而您尝试传递维度为[n_samples, n_classes]
的目标变量
策略性拆分基本上可以保留您的班级分布。而且仔细想想,多标签分类问题也没多大意义。
如果您想根据目标变量中的不同类组合来保留分布,那么答案here 解释了您可以定义自己的分层拆分函数的两种方法。
更新:
逻辑是这样的:
假设您有n
类并且您的目标变量是这些n
类的组合。您将拥有 (2^n) - 1
组合(不包括全 0)。您现在可以创建一个新的目标变量,将每个组合视为一个新标签。
例如,如果n=3
,您将拥有7
唯一组合:
1. [1, 0, 0]
2. [0, 1, 0]
3. [0, 0, 1]
4. [1, 1, 0]
5. [1, 0, 1]
6. [0, 1, 1]
7. [1, 1, 1]
将所有标签映射到这个新的目标变量。您现在可以将问题视为简单的多类分类,而不是多标签分类。
现在您可以直接使用StartefiedKFold
,使用y_new
作为您的目标。拆分完成后,您可以将标签映射回来。
代码示例:
import numpy as np
np.random.seed(1)
y = np.random.randint(0, 2, (10, 7))
y = y[np.where(y.sum(axis=1) != 0)[0]]
输出:
array([[1, 1, 0, 0, 1, 1, 1],
[1, 1, 0, 0, 1, 0, 1],
[1, 0, 0, 1, 0, 0, 0],
[1, 0, 0, 1, 0, 0, 0],
[1, 0, 0, 0, 1, 1, 1],
[1, 1, 0, 0, 0, 1, 1],
[1, 1, 1, 1, 0, 1, 1],
[0, 0, 1, 0, 0, 1, 1],
[1, 0, 1, 0, 0, 1, 1],
[0, 1, 1, 1, 1, 0, 0]])
标签编码你的类向量:
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
def get_new_labels(y):
y_new = LabelEncoder().fit_transform([''.join(str(l)) for l in y])
return y_new
y_new = get_new_labels(y)
输出:
array([7, 6, 3, 3, 2, 5, 8, 0, 4, 1])
【讨论】:
我无法理解链接中给出的解决方案。太复杂了。您能向我解释一下如何在我的问题中使用该功能吗? @SaiPavan 更新了答案。 非常感谢 我分享的代码有效。但我似乎不明白它背后的逻辑。 @SaiPavan 到底是哪一部分?我建议您阅读有关分层拆分的工作原理以及为什么sklearn
不支持它来解决多标签问题。这里的主要思想是将您的问题转换为多类问题,以便您可以应用策略拆分。以上是关于无法在多标签分类器上使用 Stratified-K-Fold的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
尝试在多标签分类问题中应用自定义损失时出现 TypeError
小白学习PyTorch教程十六在多标签分类任务上 微调BERT模型