在 virtualenv 中运行 Jupyter notebook：安装的 sklearn 模块不可用

Posted 2023-03-12

【中文标题】在 virtualenv 中运行 Jupyter notebook：安装的 sklearn 模块不可用

【英文标题】：Running Jupyter notebook in a virtualenv: installed sklearn module not available

【发布时间】：2017-07-15 22:40:59

【问题描述】：

我已经安装了一个创建的 virtualenv ma​​chinelearn 并在该环境中安装了一些 python 模块（pandas、scipy 和 sklearn）。

当我运行 jupyter notebook 时，我可以在我的笔记本中导入 pandas 和 scipy - 但是，当我尝试导入 sklearn 时，我收到以下错误消息：

import sklearn

---------------------------------------------------------------------------
ImportError                               Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-8fd979e02004> in <module>()
----> 1 import sklearn

ImportError: No module named 'sklearn'

我可以在命令行中导入所有模块 - 所以我知道它们已成功安装：

(machinelearn) me@yourbox:~/path/to/machinelearn$ python -c "import pandas, scipy, sklearn"
(machinelearn) me@yourbox:~/path/to/machinelearn$ 

如何在虚拟环境中运行的 jupyter notebook 中导入 sklearn？

【问题讨论】：

我认为您没有使用正确的 python 可执行文件启动您的笔记本。它写在页面的右侧，应该有一个下拉菜单。检查它是否是可通过 virtualenv 而不是 root 安装的 conda。

【参考方案1】：

你可能还没有在你的 virtualenv 中安装 jupyter / IPython。请尝试以下操作：

python -c "import IPython"

并检查在您的$PATH 中找到的jupyter 命令是否来自您的venv 的bin 文件夹：

which jupyter

对于 powershell 控制台中的 windows 用户，您可以使用以下命令检查您的 $env:Path 中的 jupyter 命令是否是您 venv 的 Scripts 文件夹中的命令：

get-command jupyter

编辑：如果这是问题所在，只需在您的 venv 中运行 python -m pip install jupyter。

编辑 2：实际上您可能还需要：

python -m ipykernel install --user --name=my-virtualenv-name

然后在jupyter用户界面切换名为“my-virtualenv-name”的内核。

编辑 3：也许最后一个命令中的 --user 标志是个坏主意：

python -m ipykernel install --name=my-virtualenv-name

【讨论】：

不，在我的 virtenv 中安装 jupyter 并没有解决问题，我仍然收到错误消息：ImportError: No module named 'sklearn'

> ImportError: No module named 'sklearn' 然后它确实解决了 jupyter 问题。你也只需要在你的venv中pip install scikit-learn。

@ClimbsRocks Now run the kernel "self-install" script: python -m ipykernel install --user --name=my-virtualenv-name Replacing the --name parameter as appropriate. 的回答为我解决了问题

不要忘记在 jupyter 中切换内核。

ipykernel install 有效，但不幸的是在全局范围内添加了一个新内核，即在未在此虚拟环境中运行的会话上。

【参考方案2】：

另一种方法是安装一个全局 jupyter，但指向不同的内核作为后端运行。

他们的文档中概述了这种方法： http://help.pythonanywhere.com/pages/IPythonNotebookVirtualenvs

复制以下内容以防链接中断： 你可以为你的 IPython notebook 使用 virtualenv。请按照以下步骤操作：

将 ipython 内核模块安装到您的 virtualenv 中

workon my-virtualenv-name  # activate your virtualenv, if you haven't already
pip install ipykernel

现在运行内核“自安装”脚本：

python -m ipykernel install --user --name=my-virtualenv-name

根据需要替换 --name 参数。

您现在应该能够在 IPython 笔记本菜单中看到您的内核：内核 -> 更改内核并能够切换到它（您可能需要刷新页面才能显示在列表中）。从那时起，IPython 会记住该笔记本使用哪个内核。

【讨论】：

我可以看到内核在jupyter中找到并连接到它，但它仍然找不到我的模块。想法？

@climbsrocks 是的，正如 Elliiptica 所说，我已经这样做了，但仍然无法导入包。有什么想法吗？

【参考方案3】：

使用 python3 -m venv 命令创建 virtualenv

我遇到了和你一样的问题。 在我的例子中，我使用命令创建了 virtualenv

python3 -m venv ./my_virtual_env --system-site-packages

问题是我无法在虚拟环境中安装 jupyter，因为它已经在 system-site-package 中（当您尝试安装它时，它会告诉您“要求已经满足”）。

要安装 jupyter，（在第一个实例中，pip 不会使用此命令在您的虚拟环境中安装）但仍然可以访问系统站点包，您可以运行：

python3 -m venv ./my_virtual_env

激活您的虚拟环境，运行pip3 install jupyter（和pip3 install pip），然后打开文件./my_virtual_env/pyvenv.cfg 中的选项include-system-site-packages。

在您的环境停用和重新激活后，您将可以访问系统站点包。

使用 virtualenv 命令创建 virtualenv

给定this answer，您可以通过创建文件 ./my_virtual_env/lib/python3.4/no-global-site-packages.txt 来阻止对系统站点包的访问， 并通过删除它来取回访问权限。

【参考方案4】：

要将 Jupyter 笔记本与虚拟环境（使用 virtualenvwrapper）以及安装在该环境中的软件包一起使用，请按照以下步骤操作：

创建一个虚拟环境

mkvirtualenv --no-site-packages --python=/your/python/path your_env_name

激活虚拟环境

workon your_env_name

安装 Jupyter 和其他软件包

pip install jupyter, numpy

将新内核添加到您的 Jupyter 配置中

ipython kernel install --user --name=your_env_name

完成。您现在可以在虚拟环境下使用 Jupyter notebook。

jupyter-notebook

免责声明：该问题已得到解答，但隐藏在其中一个回复中。我用谷歌搜索并花了一些时间找到正确的答案。所以我只是总结一下，以便有相同问题的人可以轻松跟进。

【讨论】：

太棒了，这直接对我有用。在第 1 步中，--python 标志对我来说是不必要的（不知道该放什么，所以把它省略了），第 2 步对我来说也是多余的。

这才是真正的答案......顺序对于完成这项工作至关重要。

从我的 env 被激活的同一个终端启动 jupyter-notebook 对我有用..谢谢！！！

第 4 步使这是一个黄金答案 - 非常感谢！高度可收藏。

【参考方案5】：

如果您使用以下方法创建了虚拟环境，您仍然可以在虚拟环境中安装 jupyter：

python -m venv --system-site-packages path/to/my-venv

只需这样做：

activate-your-env
pip install -I jupyter

你现在准备好了

jupyter notebook

【参考方案6】：

假设 jupyter 安装在您的机器上，而不是虚拟环境中。

在 Jupyter notebook 中使用虚拟环境

VENV_NAME = "你的虚拟环境名称"

1) virtualenv VENV_NAME

2) source venv/bin/activate

3) 如果不存在，请添加此包：pip3 install ipykernel

4) 然后执行这个命令：ipython kernel install --user --name=VENV_NAME

5) 现在打开 Jupyter Notebook 并在更改内核中选择 VENV_NAME

6) 要安装新软件包，请在终端中执行 pip3 install <PACKAGE NAME> 并重复第 4 步。

希望对你有帮助！

【讨论】：

5在哪里执行？在激活的 VENV_NAME 中？为什么每次安装包都要重复第 4 步？？

【参考方案7】：

不全局添加新内核的解决方案！！

通过创建一个新的虚拟环境

python3 -m virtualenv envname

激活您的环境并在其中安装 jupyter

pip install jupyter

在安装 jupyter 之前，您必须确保的一件事是您没有安装以下软件包。

ipykernel             
ipython               
ipython-genutils      
ipywidgets            
jupyter               
jupyter-client        
jupyter-console     
jupyter-core 

如果您以前安装过它们，请先通过pip uninstall 卸载它们。

在激活的 virtualenv 中安装所需的包并在其中启动 jupyter，瞧！