如何为不同的分类列创建带有编码的管道?

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【中文标题】如何为不同的分类列创建带有编码的管道?【英文标题】:How can I create a pipeline with encoding for different categorical columns? 【发布时间】:2021-06-11 20:19:29 【问题描述】:

我在尝试实现管道时遇到问题,我想在不同的分类列上使用 OrdinalEncoder 和 OneHotEncoder。

此时我的代码如下:

X = stroke_df.drop(columns=['id', 'smoking_status', 'stroke'])
y = stroke_df['stroke'].copy()

num_columns = X.select_dtypes(np.number).columns.tolist()
cat_columns = X.select_dtypes('object').columns.tolist()
all_columns = num_columns + cat_columns  # this order will need to be preserved
print('Numerical columns:', ', '.join(num_columns))
print('Categorical columns:', ', '.join(cat_columns))

num_pipeline = Pipeline([
  ('imputer', SimpleImputer(missing_values=np.nan, strategy='median')),
  ('scaler', StandardScaler())
])

cat_pipeline = ColumnTransformer([
  ('label_encoder', LabelEncoder(), ['ever_married', 'work_type']),
  ('one_hot_encoder', OneHotEncoder(), ['gender', 'residence_type'])
])

pipeline = ColumnTransformer([
  ('num', num_pipeline, num_columns),
  ('cat', cat_pipeline, cat_columns)
])

然而,在尝试在管道上调用 fit_transform 并预处理输入特征矩阵后,我得到了 TypeError:

X_prep = pipeline.fit_transform(X)
TypeError: fit_transform() takes 2 positional arguments but 3 were given

【问题讨论】:

【参考方案1】:

您的错误来自在管道中使用 LabelEncoder。 documentation 声明它应该只用于编码 y 变量。如果您的变量确实是序数,则使用序数编码器,否则使用 one-hot 编码。下面的代码也使用了一个简单的管道。

import pandas as pd
import numpy as np

from sklearn.impute import SimpleImputer
from sklearn.compose import ColumnTransformer
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler, OneHotEncoder, OrdinalEncoder

# Set-up
df = pd.DataFrame('gender': np.random.choice(['M', 'F'], size=5),
                   'ever_married': np.random.choice(['Y', 'N'], size=5),
                   'residence_type': list('ABCDE'),
                   'work_type': list('abcde'),
                   'num_col': np.array([1, 2, np.nan, 3, 4]))

ord_cols = ['ever_married', 'work_type']
ohe_cols = ['gender', 'residence_type']
num_cols = ['num_col']

# Preprocessing pipeline
num_pipeline = Pipeline([
  ('imputer', SimpleImputer(missing_values=np.nan, strategy='median')),
  ('scaler', StandardScaler())
])

pipeline = ColumnTransformer(
    [
     ('num_imputer', num_pipeline, num_cols),
     ('ord_encoder', OrdinalEncoder(), ord_cols),
     ('ohe_encoder', OneHotEncoder(), ohe_cols)
     ]
    )

# Preprocessing
X_prep = pipeline.fit_transform(df)

输出:

df

  gender ever_married residence_type work_type  num_col
0      M            Y              A         a      1.0
1      F            Y              B         b      2.0
2      F            Y              C         c      NaN
3      M            Y              D         d      3.0
4      M            N              E         e      4.0

X_prep

array([[-1.5,  1. ,  0. ,  0. ,  1. ,  1. ,  0. ,  0. ,  0. ,  0. ],
       [-0.5,  1. ,  1. ,  1. ,  0. ,  0. ,  1. ,  0. ,  0. ,  0. ],
       [ 0. ,  1. ,  2. ,  1. ,  0. ,  0. ,  0. ,  1. ,  0. ,  0. ],
       [ 0.5,  1. ,  3. ,  0. ,  1. ,  0. ,  0. ,  0. ,  1. ,  0. ],
       [ 1.5,  0. ,  4. ,  0. ,  1. ,  0. ,  0. ,  0. ,  0. ,  1. ]])

【讨论】:

非常感谢!我早一点注意到了,忘记更新帖子了;) @KRKirov - 这里没有定义序数类别的变量顺序,因此模型可能不是最优的【参考方案2】:

我也遇到了类似的问题,重点是……我只需要给我的变压器命名不同的名字……就是这样。

preprocessor = ColumnTransformer(
transformers=[
    ('num', numerical_transformer, numerical_cols),
    ('cat_ordinal', categorical_transformer_OE, ordinal_cols),
    ('cat', categorical_transformer_OH, OH_cols)
])

我认为我无法更改“num”、“cat”之类的内容。我就是这样的白痴哈哈。

(也许有人犯了类似的愚蠢错误,这可能会有所帮助:))

【讨论】:

以上是关于如何为不同的分类列创建带有编码的管道?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

如何为多标签分类器/一对休息分类器腌制 sklearn 管道?

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