如何对使用其自身输出的滞后值的函数进行矢量化?
Posted
技术标签:
【中文标题】如何对使用其自身输出的滞后值的函数进行矢量化?【英文标题】:How can I vectorize a function that uses lagged values of its own output? 【发布时间】:2017-11-11 08:02:41 【问题描述】:我很抱歉这个问题的措辞很糟糕,但这是我能做的最好的了。 我确切地知道我想要什么,但不知道如何要求它。
下面是一个例子演示的逻辑:
取值为 1 或 0 的两个条件触发一个也取值为 1 或 0 的信号。条件 A 触发信号(如果 A = 1,则信号 = 1,否则信号 = 0)无论如何。条件 B 不触发信号,但如果条件 B 保持等于 1,则信号保持触发状态 在先前的信号被条件 A 触发之后。 只有在 A 和 B 都回 0 后,信号才会回 0。
1.输入:
2。期望的输出 (signal_d) 并确认 for 循环可以解决它 (signal_l):
3.我使用 numpy.where() 的尝试:
4.可重现的 sn-p:
# Settings
import numpy as np
import pandas as pd
import datetime
# Data frame with input and desired output i column signal_d
df = pd.DataFrame('condition_A':list('00001100000110'),
'condition_B':list('01110011111000'),
'signal_d':list('00001111111110'))
colnames = list(df)
df[colnames] = df[colnames].apply(pd.to_numeric)
datelist = pd.date_range(pd.datetime.today().strftime('%Y-%m-%d'), periods=14).tolist()
df['dates'] = datelist
df = df.set_index(['dates'])
# Solution using a for loop with nested ifs in column signal_l
df['signal_l'] = df['condition_A'].copy(deep = True)
i=0
for observations in df['signal_l']:
if df.ix[i,'condition_A'] == 1:
df.ix[i,'signal_l'] = 1
else:
# Signal previously triggered by condition_A
# AND kept "alive" by condition_B:
if df.ix[i - 1,'signal_l'] & df.ix[i,'condition_B'] == 1:
df.ix[i,'signal_l'] = 1
else:
df.ix[i,'signal_l'] = 0
i = i + 1
# My attempt with np.where in column signal_v1
df['Signal_v1'] = df['condition_A'].copy()
df['Signal_v1'] = np.where(df.condition_A == 1, 1, np.where( (df.shift(1).Signal_v1 == 1) & (df.condition_B == 1), 1, 0))
print(df)
使用带有滞后值和嵌套 if 语句的 for 循环非常简单,但我无法使用像 numpy.where()
这样的矢量化函数来解决这个问题。而且我知道这对于更大的数据帧会更快。
感谢您的任何建议!
【问题讨论】:
您能否澄清一下,为什么 2017-06-13 的signal_d
应该是 1?
信号由条件 A = 1 触发,因此 signal_d 应为 1。
【参考方案1】:
我认为没有一种方法可以比 Python 循环更快地对该操作进行矢量化。 (至少,如果您只想坚持使用 Python、pandas 和 numpy,则不会。)
但是,您可以通过简化代码来提高此操作的性能。您的实现使用 if
语句和大量 DataFrame 索引。这些都是相对昂贵的操作。
这是对脚本的修改,其中包括两个函数:add_signal_l(df)
和 add_lagged(df)
。第一个是您的代码,只是包装在一个函数中。第二个使用更简单的函数来实现相同的结果——仍然是一个 Python 循环,但它使用 numpy 数组和按位运算符。
import numpy as np
import pandas as pd
import datetime
#-----------------------------------------------------------------------
# Create the test DataFrame
# Data frame with input and desired output i column signal_d
df = pd.DataFrame('condition_A':list('00001100000110'),
'condition_B':list('01110011111000'),
'signal_d':list('00001111111110'))
colnames = list(df)
df[colnames] = df[colnames].apply(pd.to_numeric)
datelist = pd.date_range(pd.datetime.today().strftime('%Y-%m-%d'), periods=14).tolist()
df['dates'] = datelist
df = df.set_index(['dates'])
#-----------------------------------------------------------------------
def add_signal_l(df):
# Solution using a for loop with nested ifs in column signal_l
df['signal_l'] = df['condition_A'].copy(deep = True)
i=0
for observations in df['signal_l']:
if df.ix[i,'condition_A'] == 1:
df.ix[i,'signal_l'] = 1
else:
# Signal previously triggered by condition_A
# AND kept "alive" by condition_B:
if df.ix[i - 1,'signal_l'] & df.ix[i,'condition_B'] == 1:
df.ix[i,'signal_l'] = 1
else:
df.ix[i,'signal_l'] = 0
i = i + 1
def compute_lagged_signal(a, b):
x = np.empty_like(a)
x[0] = a[0]
for i in range(1, len(a)):
x[i] = a[i] | (x[i-1] & b[i])
return x
def add_lagged(df):
df['lagged'] = compute_lagged_signal(df['condition_A'].values, df['condition_B'].values)
这是两个函数的时序比较,在 IPython 会话中运行:
In [85]: df
Out[85]:
condition_A condition_B signal_d
dates
2017-06-09 0 0 0
2017-06-10 0 1 0
2017-06-11 0 1 0
2017-06-12 0 1 0
2017-06-13 1 0 1
2017-06-14 1 0 1
2017-06-15 0 1 1
2017-06-16 0 1 1
2017-06-17 0 1 1
2017-06-18 0 1 1
2017-06-19 0 1 1
2017-06-20 1 0 1
2017-06-21 1 0 1
2017-06-22 0 0 0
In [86]: %timeit add_signal_l(df)
8.45 ms ± 177 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
In [87]: %timeit add_lagged(df)
137 µs ± 581 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
如您所见,add_lagged(df)
更快。
【讨论】:
感谢您的回答!这太棒了!以上是关于如何对使用其自身输出的滞后值的函数进行矢量化?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何使用 ARM Neon 内在函数对 IF 块进行矢量化?