在 R 的数据集中将 -inf、NaN 和 NA 值替换为零

Posted 2023-03-11

【中文标题】在 R 的数据集中将 -inf、NaN 和 NA 值替换为零

【英文标题】：Replace -inf, NaN and NA values with zero in a dataset in R

【发布时间】：2015-09-08 13:18:29

【问题描述】：

我正在尝试在 R 中运行一些交易策略。我已经下载了一些股票价格并计算了回报。新的返回数据集有许多 -inf、NaN 和 NA 值。我正在复制数据集的一行（log_ret）。它是一个动物园数据集。

library(zoo)
log_ret <- structure(
  c(0.234,-0.012,-Inf,NaN,0.454,Inf), .Dim = c(1L, 6L), 
  .Dimnames = list(NULL, c("x", "y", "z", "s", "p", "t")),
  index = structure(12784, class = "Date"),
  class = "zoo"
)

               x      y    z   s     p   t
2005-01-01 0.234 -0.012 -Inf NaN 0.454 Inf

如何将这些不需要的值替换为 0？

【问题讨论】：

stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/is.finite.html

【参考方案1】：

根据?zoo：

由数据包含的 zoo 对象下标 逻辑值未定义。

因此，您需要将子集包装在 which 调用中：

log_ret[which(!is.finite(log_ret))] <- 0
log_ret
               x      y z s     p t
2005-01-01 0.234 -0.012 0 0 0.454 0

【参考方案2】：

Inf、NA和NaN匹配!is.finite，例如

a <- c(1, Inf, NA, NaN)
a[!is.finite(a)] <- 0
# a is now [1, 0, 0, 0]

我对操作zoo对象了解不多，但对于上面的例子

log_ret[1, !is.finite(log_ret)] <- 0

有效。在您的实际数据中，您将不得不遍历所有行。可能有一种zoo 特定的方式来执行此操作。

编辑：动物园特有的方式是log_ret[which(!is.finite(log_ret))] <- 0。

【讨论】：

我之前也试过。但由于某种原因，数据集中的值都没有改变。

确保不要混淆is.finite()和is.infinite()

【参考方案3】：

另一种方法是（其中 df=您的数据框）：

is.na(df)<-sapply(df, is.infinite)
df[is.na(df)]<-0

我不知道这是否适用于动物园对象，但它解决了 is.infinite() 仅适用于向量的问题。

问题中的

log_ret 不是 data.frame。如果 df 为 log_ret，则此代码会出错。

【参考方案4】：

在 dplyr 中使用 mutate_all：

library(dplyr)
fortify.zoo(log_ret) %>% mutate_all(function(x) ifelse(is.infinite(x), 0, x))  

【讨论】：

该代码给出错误：Error in UseMethod("tbl_vars") : no applicable method for 'tbl_vars' applied to an object of class "zoo"

这不再给出错误，而是给出了一个数据框，而需要一个动物园对象。

【参考方案5】：

由于mutate_all 的生命周期已被across 的使用所取代：

library(dplyr)
fortify.zoo(log_ret) %>% mutate(across(.cols = everything(), ~ ifelse(is.infinite(.x), 0, .x)))