安装 ncdf4 包：错误，nc-config 未找到或不可执行

Posted 2023-03-11

【中文标题】安装 ncdf4 包：错误，nc-config 未找到或不可执行

【英文标题】：Install ncdf4 package: Error, nc-config not found or not executable

【发布时间】：2017-08-10 23:46:03

【问题描述】：

我尝试安装ncdf4 包。我有 R 版本 3.1.1。

问题似乎在于找到nc-config。如果我用谷歌搜索这个特定问题，那么我会找到有同样问题的人，他们通过在安装 ncdf4 之前安装 Debian 软件包 libnetcdf-dev 解决了这个问题。

我已经安装了那个包，但我一直遇到同样的问题，

错误如下：

checking for nc-config... no
-----------------------------------------------------------------------------------
Error, nc-config not found or not executable.  This is a script that comes with the netcdf library, version 4.1-beta2 or later, and must be present for configuration to succeed.

【问题讨论】：

你可以做的是打开一个新的终端并执行which nc-config。这将显示文件在系统中的实际位置。如果确实安装了此文件，则问题可能是 Linux 将其安装在给定位置，而 R 期望它在其他位置（例如 /usr/local/bin 与 /usr/bin）。您可以尝试通过将包含 nc-config 的库添加到您的 PATH 环境变量来解决此问题。或者问题可能是无关的，例如32 位与 64 位。\

【参考方案1】：

我遇到了类似的问题，这些答案对我来说不太适用（Ubuntu 16.04.4 LTS）。

我必须使用以下方式安装开发者版本：

sudo apt-get install libnetcdf-dev

【讨论】：

它适用于 Ubuntu 18.04 和 R 版本 3.4.4 (2018-03-15)。

和 19.10, 3.6.1

贡献者@Faith-Jones 报告说这也适用于 Ubuntu 20.04。

这对我来说适用于 Linux Mint 20.1 “Ulyssa”！谢谢！

【参考方案2】：

在 CentOS 7 上，在终端中使用 sudo yum install netcdf-devel.x86_64 就可以了。

【讨论】：

yum install netcdf-devel

【参考方案3】：

正如@PaulHiemstra 在 cmets 中提到的，找出你的 nc-config 的位置：

你可以做的是打开一个新的终端并执行which nc-config。这 将显示文件在系统中的实际位置。如果 确实安装了这个文件，问题可能是Linux 将它安装在给定的位置，而 R 期望它在其他地方 （例如 /usr/local/bin 与 /usr/bin 对比）。您可以尝试解决问题 通过将包含 nc-config 的库添加到您的 PATH 环境中 多变的。或者问题可能是无关的，例如32 位与 64 位。\

对我来说是：

ubuntu@dark-horse:~$ which nc-config 
/home/ubuntu/miniconda3/bin/nc-config

我首先使用以下命令安装 netcdf 基本要素

sudo apt-get install r-cran-ncdf4

上面的命令应该已经安装了nc-config，如果没有尝试：

sudo apt-get install netcdf-bin

现在，下载 netcdf4 源代码

wget http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/ncdf4_1.13.tar.gz

现在，尝试安装

sudo R CMD INSTALL ncdf4_1.13.tar.gz --configure-args="--with-nc-config=/home/ubuntu/miniconda3/bin/nc-config"

【参考方案4】：

我也遇到同样的问题，但是你需要安装

sudo apt install libgdal-dev libproj-dev libgeos-dev libudunits2-dev libnode-dev libcairo2-dev libnetcdf-dev

和

sudo apt install libglu1-mesa-dev freeglut3-dev mesa-common-dev

这将解决问题