如何用HDF5源代码编译c程序？

Posted 2023-03-11

【中文标题】如何用HDF5源代码编译c程序？

【英文标题】：How to compile c program with HDF5 source code?

【发布时间】：2017-08-26 08:28:19

【问题描述】：

我有特定的要求，我想编译和执行一些具有 HDF5 依赖项的代码。 我不想用hdf5 compiler，但我想编译HDF5源代码。

我对如何将 HDF5 链接到我的 C 程序非常陌生。请您详细说明如何执行此操作，以便我可以使用 c 编译器执行此程序并链接从here 下载的源文件。

示例 C 程序 -

/* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
 * Copyright by The HDF Group.                                               *
 * Copyright by the Board of Trustees of the University of Illinois.         *
 * All rights reserved.                                                      *
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 * This file is part of HDF5.  The full HDF5 copyright notice, including     *
 * terms governing use, modification, and redistribution, is contained in    *
 * the files COPYING and Copyright.html.  COPYING can be found at the root   *
 * of the source code distribution tree; Copyright.html can be found at the  *
 * root level of an installed copy of the electronic HDF5 document set and   *
 * is linked from the top-level documents page.  It can also be found at     *
 * http://hdfgroup.org/HDF5/doc/Copyright.html.  If you do not have          *
 * access to either file, you may request a copy from [e-mail].     *
 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * */

/*
 *  This example illustrates how to create a dataset that is a 4 x 6 
 *  array.  It is used in the HDF5 Tutorial.
 */

#include "hdf5.h"
#define FILE "dset.h5"

int main() 

   hid_t       file_id, dataset_id, dataspace_id;  /* identifiers */
   hsize_t     dims[2];
   herr_t      status;

   /* Create a new file using default properties. */
   file_id = H5Fcreate(FILE, H5F_ACC_TRUNC, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);

   /* Create the data space for the dataset. */
   dims[0] = 4; 
   dims[1] = 6; 
   dataspace_id = H5Screate_simple(2, dims, NULL);

   /* Create the dataset. */
   dataset_id = H5Dcreate2(file_id, "/dset", H5T_STD_I32BE, dataspace_id, 
                          H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);

   /* End access to the dataset and release resources used by it. */
   status = H5Dclose(dataset_id);

   /* Terminate access to the data space. */ 
   status = H5Sclose(dataspace_id);

   /* Close the file. */
   status = H5Fclose(file_id);

【参考方案1】：

为了编译，必须让-I 标志指向HDF5 的包含目录。对于系统安装，它通常是/usr/include，但根据 HDF5 是串行安装还是并行安装、32/64 位等，会有很多变化。用于链接 -L 和 -l 标志是那些那件事。 -L 应该指向包含 HDF5 库的 .so、.dll 或 .dylib 文件的目录（同样，可能存在变化），-l 只是给出库名称，-lhdf5 和其他（我相信-lz 和-lm 几乎总是被使用）。如果使用高级库，则需要-lhdf5_hl。

检查这些标志的最简单方法是调用

h5cc -show

这将列出所有内容。

PS：您可以一步编译和链接（从.c 到可执行文件）或先编译（.c 到.o）然后链接（.o 到可执行文件）。在第一种情况下，需要所有 -I、-L 和 -l 标志。