如何在 CentOS6 上启动/停止/刷新 OpenCPU？

Posted 2023-03-10

【中文标题】如何在 CentOS6 上启动/停止/刷新 OpenCPU？

【英文标题】：How to start/stop/flush OpenCPU on CentOS6?

【发布时间】：2014-12-29 15:11:56

【问题描述】：

我已经在 CentOS6 上成功构建并安装了 OpenCPU 和 RStudio Server。一切都按预期工作，我的本地 R 包确实获得了成功的 GET/POST 响应。

有几件事似乎不起作用：

我想不出一个干净的方法来启动/停止/刷新 OpenCPU。我目前正在使用apachectl restart，但我什至不确定是否会按预期重新加载 R 包。我在/usr/lib/opencpu/scripts 尝试了 Jeroen 的 bash 脚本，但它们似乎需要进行相当多的调整才能在 CentOS 上运行。 （可能与上述有关）我在/etc/opencpu/Renviron 文件中使用load() 和readRDS()（也在/etc/opencpu/Rprofile 中尝试过）将持久数据集加载到全局环境中——但这似乎不起作用.我没有收到任何错误日志，但这些对象在后续请求中不可用。 在 Ubuntu OpenCPU 上似乎配置为在 opencpu 用户下运行。在 CentOS6 上，安装后它似乎在root 下运行。我想修改它，但不确定如何修改。

只是想知道是否有人在 CentOS6 上成功配置了 OpenCPU。

非常感谢，--梅尔。

【参考方案1】：

一些答案​​

运行sudo apachectl restart 将重新启动。目前 rpm 中没有用于 opencpu 的特殊 init 或 systemd 脚本，但基本上该脚本在 ubuntu 上所做的只是重新启动 apache 并将一些消息打印到终端。

REnviron 文件仅用于环境变量。自定义代码需要使用RProfile。另见help。也许它没有在正确的环境中加载。试试：load(file, envir = globalenv(), verbose = TRUE)。

请注意，推荐的存储方式是将其放入 R 包中，作为延迟加载数据或 sysdata.rda（请参阅 writing R extensions）。然后，您可以在启动时加载或附加包，或者更好的是：从包含您的应用程序或 R 函数的包中正式导入数据集。

Afaik，centos 以用户 apache 的身份运行 httpd 请求？是什么让您认为 opencpu 以 root 身份运行？这当然不是本意。在 CentOS 上，您有时需要使用 SELinux httpd 标志来让您的应用程序正常工作，另请参阅 rpm readme。

rpm 包比 debian 的包更新且测试较少，所以如果您有问题或建议，请在 github 上提出问题。

【讨论】：

谢谢，这一切都澄清了。我按照建议构建并加载了一个单独的数据包，它比在Rprofile 中编辑自定义指令更有效并且更精简。我对以 root 身份运行的 OpenCPU 感到困惑（我确实有一个以 root 身份运行的 httpd 进程，但结果并不相关）。关于使用 OpenCPU 配置持久变量和数据集的文档有点分散，我花了一段时间才找到最佳方法。在 OpenCPU 服务器手册中添加一节可能很有用。

是的，我知道我不擅长文档。也许可以创建一个 wiki 左右，让人们帮助创建一些手册。

你找到在CentOS6上配置opencpu运行用户库的方法了吗：server.com/ocpu/user//library？这似乎在 user = apache 时有效，但在其他情况下无效。

@user338714 你遇到了什么错误？你read about SELinux了吗？

是的，我按照说明在 CentOS6 上构建和安装（我使用的是 RHEL 机器）并暂时禁用了 SELinux。当我尝试查看某个用户下的库时，我收到一条消息，指出找不到该用户，但 apache 用户除外，它说没有找到任何库。该机器还运行着 rstudio 服务器和闪亮服务器，我希望使用类似于 per_user 闪亮设置的 opencpu。如果我不包含 ../user//.. 在 url 中，一切正常。