如何在python numpy中创建随机正交矩阵
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【中文标题】如何在python numpy中创建随机正交矩阵【英文标题】:How to create random orthonormal matrix in python numpy 【发布时间】:2016-11-20 10:46:28 【问题描述】:有没有可以调用的方法在 python 中创建随机正交矩阵?可能使用numpy?或者有没有办法使用多个 numpy 方法创建一个正交矩阵?谢谢。
【问题讨论】:
【参考方案1】:scipy 0.18 版具有scipy.stats.ortho_group
和scipy.stats.special_ortho_group
。添加它的拉取请求是https://github.com/scipy/scipy/pull/5622
例如,
In [24]: from scipy.stats import ortho_group # Requires version 0.18 of scipy
In [25]: m = ortho_group.rvs(dim=3)
In [26]: m
Out[26]:
array([[-0.23939017, 0.58743526, -0.77305379],
[ 0.81921268, -0.30515101, -0.48556508],
[-0.52113619, -0.74953498, -0.40818426]])
In [27]: np.set_printoptions(suppress=True)
In [28]: m.dot(m.T)
Out[28]:
array([[ 1., 0., -0.],
[ 0., 1., 0.],
[-0., 0., 1.]])
【讨论】:
感谢您的回复。我注意到给出的答案都是关于方阵的。我还能用这个方法得到一个d x k矩阵,其中k 构造一个 d x d 矩阵,然后删除多余的列【参考方案2】:您可以通过对具有元素 i.i.d 的n x n
矩阵执行QR
分解来获得随机的n x n
正交矩阵Q
,(均匀分布在n x n
正交矩阵的流形上)。均值0
和方差1
的高斯随机变量。这是一个例子:
import numpy as np
from scipy.linalg import qr
n = 3
H = np.random.randn(n, n)
Q, R = qr(H)
print (Q.dot(Q.T))
[[ 1.00000000e+00 -2.77555756e-17 2.49800181e-16] [ -2.77555756e-17 1.00000000e+00 -1.38777878e-17] [ 2.49800181e-16 -1.38777878e-17 1.00000000e+00]]
编辑:(在@gg g 发表评论后重新访问此答案。)定理 2.3 建议了上述关于提供均匀分布(在所谓的 Stiefel 流形上)正交矩阵的高斯矩阵的 QR 分解的声明this reference 的 .18-19。请注意,结果的陈述表明“类似 QR”的分解,但是,三角矩阵 R
具有正元素。
显然,scipy(numpy)函数的qr
函数不保证R
的正对角元素,而对应的Q
实际上不一致分散式。这已在this 专着中观察到,秒。 4.6(讨论指的是 MATLAB,但我猜 MATLAB 和 scipy 都使用相同的 LAPACK 例程)。建议将qr
提供的矩阵Q
通过后乘以随机酉对角矩阵来修改。
下面我在上面的参考中重现了实验,绘制了qr
提供的“直接”Q
矩阵的特征值相位的经验分布(直方图),以及“修改”版本,其中它可以看出,修改后的版本确实具有均匀的特征值相位,正如从均匀分布的正交矩阵所预期的那样。
from scipy.linalg import qr, eigvals
from seaborn import distplot
n = 50
repeats = 10000
angles = []
angles_modified = []
for rp in range(repeats):
H = np.random.randn(n, n)
Q, R = qr(H)
angles.append(np.angle(eigvals(Q)))
Q_modified = Q @ np.diag(np.exp(1j * np.pi * 2 * np.random.rand(n)))
angles_modified.append(np.angle(eigvals(Q_modified)))
fig, ax = plt.subplots(1,2, figsize = (10,3))
distplot(np.asarray(angles).flatten(),kde = False, hist_kws=dict(edgecolor="k", linewidth=2), ax= ax[0])
ax[0].set(xlabel='phase', title='direct')
distplot(np.asarray(angles_modified).flatten(),kde = False, hist_kws=dict(edgecolor="k", linewidth=2), ax= ax[1])
ax[1].set(xlabel='phase', title='modified');
【讨论】:
你怎么知道得到的矩阵均匀分布在流形上?并根据歧管上的什么度量? @gg 感谢您的评论!实际上,qr
的“直接”应用并没有提供均匀分布的正交矩阵。请参阅编辑后的答案以获取解决方法。
很好的答案!参考文献中肯,非常感谢!
不需要随机角度,只需使用R对角线的符号即可:Q_modified = Q @ np.diag(np.sign(np.diag(R))
【参考方案3】:
这是从https://github.com/scipy/scipy/pull/5622/files 中提取的rvs
方法,改动很小 - 足以作为独立的 numpy 函数运行。
import numpy as np
def rvs(dim=3):
random_state = np.random
H = np.eye(dim)
D = np.ones((dim,))
for n in range(1, dim):
x = random_state.normal(size=(dim-n+1,))
D[n-1] = np.sign(x[0])
x[0] -= D[n-1]*np.sqrt((x*x).sum())
# Householder transformation
Hx = (np.eye(dim-n+1) - 2.*np.outer(x, x)/(x*x).sum())
mat = np.eye(dim)
mat[n-1:, n-1:] = Hx
H = np.dot(H, mat)
# Fix the last sign such that the determinant is 1
D[-1] = (-1)**(1-(dim % 2))*D.prod()
# Equivalent to np.dot(np.diag(D), H) but faster, apparently
H = (D*H.T).T
return H
它符合 Warren 的测试,https://***.com/a/38426572/901925
【讨论】:
【参考方案4】:创建任何形状 (n x m
) 正交矩阵的简单方法:
import numpy as np
n, m = 3, 5
H = np.random.rand(n, m)
u, s, vh = np.linalg.svd(H, full_matrices=False)
mat = u @ vh
print(mat @ mat.T) # -> eye(n)
注意,如果n > m
,它将获得mat.T @ mat = eye(m)
。
【讨论】:
我认为您应该将rand
更改为randn
以获得矩阵的均匀分布。否则,我认为这是最好的答案。【参考方案5】:
如果您想要一个具有正交列向量的非方阵,您可以使用上述任何一种方法创建一个方阵并删除一些列。
【讨论】:
【参考方案6】:from scipy.stats import special_ortho_group
num_dim=3
x = special_ortho_group.rvs(num_dim)
Documentation
【讨论】:
【参考方案7】:Numpy 也有 qr 分解。 https://numpy.org/doc/stable/reference/generated/numpy.linalg.qr.html
import numpy as np
a = np.random.rand(3, 3)
q, r = np.linalg.qr(a)
q @ q.T
# array([[ 1.00000000e+00, 8.83206468e-17, 2.69154044e-16],
# [ 8.83206468e-17, 1.00000000e+00, -1.30466244e-16],
# [ 2.69154044e-16, -1.30466244e-16, 1.00000000e+00]])
【讨论】:
以上是关于如何在python numpy中创建随机正交矩阵的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
在 Python、NumPy 和 R 中创建相同的随机数序列