ggplot 不会将 alpha 值应用于某些数据点

Posted 2023-02-16

【中文标题】ggplot 不会将 alpha 值应用于某些数据点

【英文标题】：ggplot won't apply alpha value to some data points

【发布时间】：2022-01-14 12:30:30

【问题描述】：

ggplot 的绝对初学者。我正在绘制iris 数据集，当我设置alpha=0.5 时，它不适用于某些数据点。 代码如下：

ggplot(iris)+
  geom_point(aes(Sepal.Length,Sepal.Width,colour=Species),size=5,alpha=0.5)+
  labs(x="Sepal Length",y="Sepal Width")+
  theme_minimal()

这是我得到的输出。可以看出，alpha 值在整个数据点上并不一致。

【问题讨论】：

这不是正确的解释。这些点更暗正是因为alpha 以及某些点在数据中重复（因此在这些位置有多个半透明点）。参见table(with(iris, table(Sepal.Width, Sepal.Length)))，表明 90 次宽度/长度对是唯一的，22 次有两个这样的对，4 次有 3 行具有相同的对，1 次有 4 个这样的行。

稍微详细一点的是with(iris, table(Sepal.Width, Sepal.Length)) 显示对（列/行组合）以及每个出现的次数（表中的值）。

是的，没错。

@MoonChild 这就是透明度。如果您想要均匀的浅色，则保持完全不透明度并选择较浅的颜色。透明的好处是你可以看到下面的一些东西。

我不会认为这是使用 geom_point 的负面影响。在很多情况下，您希望 is 使用不透明度来显示多个观察值具有相同的坐标。这是一个故意的问题，你正在策划什么，如何以及为什么。就像如果您不想看到基于不透明度的重叠点，请不要将 alpha 设置为低于 1。

【参考方案1】：

正在应用 alpha 值，但您看到的是由于某些点与其他点完全重叠。如果您选择 geom_jitter 而不是 geom_point，您可以看到这一点：

ggplot(iris)+
  geom_jitter(aes(Sepal.Length,Sepal.Width,colour=Species),size=5,alpha=0.5)+
  labs(x="Sepal Length",y="Sepal Width")+
  theme_minimal()

当您将 alpha 设置为 0.5 时，这意味着如果有 2 个重叠点，那么您将获得全彩 (2 * 0.5 = 1)。如果您希望点即使有重叠也保持透明，那么您可以简单地选择较低的 alpha 值。重叠会变暗这一事实是一个很好的特性，因为这意味着您可以看到可能存在大点簇的位置。