迁移数据的玫瑰图

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【中文标题】迁移数据的玫瑰图【英文标题】:Rose diagram for migration data 【发布时间】:2018-07-25 12:25:39 【问题描述】:

我正在尝试创建一个玫瑰图,显示每个细胞子集的平均轨迹角度和距离。我希望玫瑰图周围的角度为轨迹角,图中条形的长度为总位移。

这是每组平均角度和位移的测试数据集。

testsum<-data.frame(Group=c(1,2,3),
                angle=c(0.78,1.04,2.094),
                displacement=c(1.5,2,1))

当我尝试以循环方式绘制时,我的图表看起来非常错误。

p1<-ggplot(testsum, aes(x=angle,y=displacement))+
  coord_polar(theta="x",start=0)+
  geom_bar(stat="identity",aes(color=Group,fill=Group),width=.01)+    
  scale_x_continuous(breaks=seq(0,360,60))

它给了我这个输出图。

根据数据显示,它应该看起来更像这样(绘制预期输出)。

似乎放置角度不正确?知道我做错了什么吗?

【问题讨论】:

在预期的图表组 3 出现两次。有错吗? 是的,这是错误的。我更新了我的图表。 喜欢图表编辑! 【参考方案1】:

也许你可以使用 open air 包中的 windRose 功能

library(openair)
    testsum<-data.frame(Group=c(1,2,3),angle=c(0.78,1.04,2.094),displacement=c(1.5,2,1))
    testsum$angle=180*testsum$angle/pi
windRose(testsum,ws="displacement",wd="angle",breaks=c(0.5,1,1.5,2),paddle=F,key.header = "My Rose",angle=10, 
     statistic="prop.mean",key.footer = "Displacement")

【讨论】:

【参考方案2】:

也许你可以试试这个:

testsum$angle_b=180*testsum$angle/pi
#
ggplot(testsum, aes(x=angle_b,y=displacement))+
    geom_bar(stat="identity",aes(color=Group,fill=Group),width=1) +    
    scale_x_continuous(breaks=seq(0,360,10), limits=c(0,360)) + coord_polar(direction=1)

【讨论】:

【参考方案3】:

虽然 MLavoie “比我快 20 分钟”,但我认为使用 NISTunits 包可以增加一些可读性:

library(ggplot2)
library(NISTunits)

testsum <- data.frame(
  Group = c(1, 2, 3),
  angle = c(0.78, 1.04, 2.094),
  displacement = c(1.5, 2, 1)
)

testsum$angle = NISTradianTOdeg(testsum$angle)

ggplot(testsum, aes(x = angle, y = displacement)) +
  coord_polar(theta = "x", start = NISTdegTOradian(-90), direction = 1) +
  geom_bar(stat = "identity",
           aes(color = Group, fill = Group),
           width = 1) +
  scale_x_continuous(breaks = seq(0, 360, 10), limits = c(0, 360))

结果:

剪切下半部分检查this answer.

【讨论】:

以上是关于迁移数据的玫瑰图的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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