R中igraph中转置边缘列表的邻接

Posted 2023-02-24

【中文标题】R中igraph中转置边缘列表的邻接

【英文标题】：Adjacency to transposed edgelist in igraph in R

【发布时间】：2012-05-05 03:48:42

【问题描述】：

我有一个相对较大的 2 模式网络，采用 4000 行和 9000 列的邻接矩阵形式，我有兴趣查看列之间的关系。

对于较小的网络，我会使用t(matrix) %*% matrix，但是我认为 9000^2 矩阵会最大化我计算机上的内存。

一种选择是将igraph邻接矩阵转换为sna pacakge格式，并使用sna::gt，但我想知道igraph中是否有类似的功能？

谢谢，

【参考方案1】：

使用graph.incidence 从邻接矩阵构造二分图，然后使用bipartite.projection 根据行或列将其投影到相应的单模网络。

【讨论】：

谢谢！我不知道bipartite.projection 命令（显然）。