使用 Emscripten 将 R 函数编译为 JavaScript

Posted 2023-02-22

【中文标题】使用 Emscripten 将 R 函数编译为 JavaScript

【英文标题】：Compiling R functions to JavaScript with Emscripten

【发布时间】：2015-02-17 23:37:09

【问题描述】：

我正在尝试使用 Emscripten 将一些用 C 编写的 R 函数编译为 javascript。我的第一个任务是移植一个名为 pf 的函数。

来源可以在here找到。所以，我进入 src 目录并尝试运行：

(trunk)⚡ % emcc -s EXPORTED_FUNCTIONS="['_Rf_pf']" nmath/pf.c
warning: unresolved symbol: Rf_pbeta
warning: unresolved symbol: Rf_pchisq
warning: unresolved symbol: R_NaN
warning: unresolved symbol: R_NegInf
warning: unresolved symbol: R_PosInf

我在输出 JavaScript 中得到一个函数 _Rf_pf。我实际上可以调用这个函数并返回一个结果。但是，由于R_PosInf 和公司没有解决，它在R_P_bounds_01(x, 0., ML_POSINF); 上短路。 ML_POSINF 以某种方式设置为 0 给出奇怪的结果。所以，算法的核心并没有被执行。

有谁知道如何解决这些符号并移植此功能？

我可以尝试编译更多源代码，这似乎让我有所收获：

$ emcc -s EXPORTED_FUNCTIONS="['_Rf_pf']" nmath/pf.c nmath/pbeta.c nmath/pchisq.c 
warning: unresolved symbol: R_finite
warning: unresolved symbol: Rf_pgamma
warning: unresolved symbol: Rf_warning
warning: unresolved symbol: bratio
warning: unresolved symbol: gettext
warning: unresolved symbol: R_NaN
warning: unresolved symbol: R_NegInf
warning: unresolved symbol: R_PosInf

但是，这似乎将我引向了一个巨大的兔子洞。然后，我遇到了一些障碍：

 $ emcc -s EXPORTED_FUNCTIONS="['_Rf_pf']" nmath/pf.c nmath/pbeta.c nmath/pchisq.c main/arithmetic.c 
In file included from main/arithmetic.c:35:
include/Defn.h:201:3: error: SIZE_MAX is required for C99
# error SIZE_MAX is required for C99
  ^
include/Defn.h:639:9: error: unknown type name 'R_size_t'
extern0 R_size_t R_NSize  INI_as(R_NSIZE);/* Size of cons cell heap */
        ^
include/Defn.h:640:9: error: unknown type name 'R_size_t'
extern0 R_size_t R_VSize  INI_as(R_VSIZE);/* Size of the vector heap */
        ^
...
fatal error: too many errors emitted, stopping now [-ferror-limit=]

请注意，我设置了 CPATH。我不知道这是否是将编译器指向我需要的不同标头的方法：

(trunk)⚡ % echo $CPATH
gnuwin32/fixed/h/:/usr/local/Cellar/r/3.1.2_1/include/:/usr/local/Cellar/r/3.1.2_1/R.framework/Versions/3.1/Resources/include/:nmath/:include/:main/:include/R_ext

【参考方案1】：

如果要使用gnuwin32/fixed/h/config.h，则需要-DHAVE_CONFIG_H。

https://github.com/wch/r-source/blob/trunk/src/gnuwin32/Makefile

【讨论】：

谢谢，很好的信息。但是，它并没有多大帮助。我从运行 ./configure 得到了一个非 Windows config.h，我现在将它包含在 -DHAVE_CONFIG_H 中，但问题仍然存在。