使用 SHAP 的 Tkinter 回调异常
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【中文标题】使用 SHAP 的 Tkinter 回调异常【英文标题】:Exception in Tkinter callback using SHAP 【发布时间】:2020-09-16 22:56:25 【问题描述】:我正在尝试在 Python 中绘制一些 SHAP plots,以更深入地了解我的机器学习模型的输出。这是我在 for 循环中调用的方法:
def plotAndSaveSHAPSummary(model,train_data,x_train,pathToSHAPPlots):
shap_values = model.get_feature_importance(train_data, type='ShapValues')
expected_value = shap_values[0,-1]
shap_values = shap_values[:,:-1]
shap.summary_plot(shap_values,x_train,max_display=20,show=False)
plt.savefig(pathToSHAPPlots+'/SHAP Plots/SHAP_Plot'+str(counter)+'.png',dpi=300,bbox_inches='tight')
plt.clf()
绘图按预期保存到磁盘,但每次调用 savefig 方法后,我都会收到以下错误消息:
Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
File "D:\PathTo\Anaconda\Lib\tkinter\__init__.py", line 1705, in __call__
return self.func(*args)
File "D:\PathTo\Anaconda\Lib\tkinter\__init__.py", line 749, in callit
func(*args)
File "D:\PathTo\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\_backend_tk.py", line 270, in idle_draw
self.draw()
File "D:\PathTo\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\backend_tkagg.py", line 9, in draw
super(FigureCanvasTkAgg, self).draw()
File "D:\PathTo\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\backend_agg.py", line 393, in draw
self.figure.draw(self.renderer)
File "D:\PathTo\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backend_bases.py", line 1535, in _draw
def _draw(renderer): raise Done(renderer)
matplotlib.backend_bases._get_renderer.<locals>.Done: <matplotlib.backends.backend_agg.RendererAgg object at 0x000002066B288288>
任何想法如何摆脱这个异常?
【问题讨论】:
我最近只使用 matplotlib 遇到了同样的错误,并通过在 savefig 调用之前添加一个小的 plt.pause(1e-13) 来解决它(hackily)。我不知道为什么会这样,但假设 matplotlib 代码中的某处存在竞争条件。 【参考方案1】:在更新其中一个库(可能是 matplot 库)后,我也开始收到此错误。评论中描述的使用plt.pause
的建议有效,但它在内部调用plt.show()
,这对我来说是不可接受的。我最终在savefig
之前添加了canvas.start_event_loop
import sys
def _save(self, filename: str) -> None:
fig1 = plt.gcf()
fig1.set_size_inches(6, 2.8)
plt.draw()
fig1.subplots_adjust(left=0.20)
fig1.canvas.start_event_loop(sys.float_info.min) #workaround for Exception in Tkinter callback
fig1.savefig(self.dst_dir + '/' + filename + '.png', dpi=220, bbox_inches='tight')
fig1.clf()
plt.close()
【讨论】:
【参考方案2】:plt.ioff()
帮我搞定了
【讨论】:
【参考方案3】:我也有同样的问题。我在 Python 中有一个简单的脚本来制作一个过去可以正常工作的图表,但现在当它尝试保存文件时,会显示确切的警告。我花了很多时间试图弄清楚发生了什么,因为错误是突然的,并且消息不是很丰富。
我发现当我在savefig
中省略bbox_inches
参数时它会消失。
我注意到安装python-tk
后开始出现错误,但卸载它并没有帮助。
[Mariu 的回答]plt.ioff()
对我不起作用。
[nan 的回答]fig1.canvas.start_event_loop(sys.float_info.min)
确实有效。
【讨论】:
【参考方案4】:我在使用 matplot lib 保存多个绘图时遇到了同样的问题。保存数字后添加 plt.close() 对我有用。
【讨论】:
以上是关于使用 SHAP 的 Tkinter 回调异常的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
SHAP 异常:TreeExplainer 中的可加性检查失败