RStudio 在启动时找不到我的库

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【中文标题】RStudio 在启动时找不到我的库【英文标题】:RStudio can't find my library on startup 【发布时间】:2013-01-07 18:01:39 【问题描述】:

几周前我在RStudio support forums 上问过这个问题,但那里没有解决,所以我在这里尝试。

我在 Windows 7 和 R 2.15.2 上使用 RStudio 0.97.248(当前版本)。

当我打开 RStudio 时,在正常的 R 版本信息之后,出现两个错误:

Error in packageVersion("knitr") : package ‘knitr’ not found  Error in
packageVersion("Rcpp") : package ‘Rcpp’ not found

但我可以使用require() 毫无问题地加载这两个包。 (也就是说,在启动 RStudion 的错误之后,我可以输入 require(knitr)knitr 将成功加载。真正的问题是我不能使用,例如,R Markdown 文档上的 Knit html 命令,甚至手动加载knitr后。如果我用require(knitr)加载knitr,然后打开一个新的R Markdown文档(RStudio默认为一个不错的模板),保存它并尝试编织HTML,RStudio给我一个小错误R Markdown 文档顶部的消息

R Markdown 需要 knitr 包(0.5 或更高版本)

我假设 RStudio 没有查看正确的库路径。

> .libPaths()
[1] "\\\\gregorp.homedir.nebula.washington.edu/homes/R/win-library/2.15"
[2] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"                               
[3] "C:/Program Files/RStudio/R/library"

第一个条目是我可以安装包的地方(以及我的Rcppknitr 安装位置)。我想我和this guy 有同样的问题,但讨论不连贯。

我尝试添加该行

.Library.site <- "\\\\gregorp.homedir.nebula.washington.edu/homes/R/win-library/2.15"

到我的R-2.15.2/etc/ 文件夹中的Rprofile.site 文件,但问题仍然存在。

【问题讨论】:

如果你更新这两个包你会怎样? 如果您将 RStudio 退出循环,并从命令行运行 R 会怎样? @Spacedman 从命令行(或 R GUI)require(knitr)require(Rcpp) 工作得很好。即使在 RStudion 中,显式输入这些命令也可以正常工作。但是,如果我尝试在 RStudio 中 Knit HTML 一个 R Markdown 文档,即使在使用 require(knitr) 成功手动加载 knitr 之后,我也会收到“R Markdown 需要 knitr 包”的错误消息。 (编辑以将此信息添加到问题中。) @agstudy 我的包是最新的。 【参考方案1】:

我决定从头开始,我重新安装了 R 和 RStudio,并删除了我的旧库。

一个有风险的选择是以管理员身份运行 R(或 RStudio)——这允许我安装到默认库中,从而避免了使用单独库的问题。

在较新版本的 RStudio 中,我使用单独的库没有问题,在我的 Rprofile.site 文件中指定站点库。

【讨论】:

以上是关于RStudio 在启动时找不到我的库的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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