ggplot2 根据因子设置 geom_point 大小

Posted 2023-02-14

【中文标题】ggplot2 根据因子设置 geom_point 大小

【英文标题】：ggplot2 Set geom_point Size according to a Factor

【发布时间】：2022-01-17 08:37:49

【问题描述】：

我正在尝试根据一个因素设置geom_point 的大小。我知道不建议这样做，但我的数据非常不平衡（最小值为 6，而最大值大于 10,000）。

我试图使点的大小反映研究的总样本量。我将总样本量分为 6 个级别：小于 100； 100 至 500； 500 至 1,000； 1,000 至 5,000； 5,000 至 10,000；超过 10,000 个。

这是我的尝试：

rct_findings <- findings %>% 
  mutate(
   
    Sample_Size_Range = case_when(
      0 < Outcome_Sample_Size & Outcome_Sample_Size <= 100 ~ "0 < n <= 100",
      100 < Outcome_Sample_Size & Outcome_Sample_Size <= 500 ~ "100 < n <= 500",
      500 < Outcome_Sample_Size & Outcome_Sample_Size <= 1000 ~ "500 < n <= 1,000",
      1000 < Outcome_Sample_Size & Outcome_Sample_Size <= 5000 ~ "1,000 < n <= 5,000",
      5000 < Outcome_Sample_Size & Outcome_Sample_Size <= 10000 ~ "5,000 < n <= 10,000",
      10000 < Outcome_Sample_Size ~ "10,000 < n"),
    
    Sample_Size_Range = fct_relevel(Sample_Size_Range, c("0 < n <= 100", "100 < n <= 500", "500 < n <= 1,000", "1,000 < n <= 5,000", "5,000 < n <= 10,000", "10,000 < n")))

ggplot(rct_findings, aes(x = Effect_Size_Study, y = F_test_var_stat, size = as_factor(Sample_Size_Range))) +
  geom_point() 

我得到的错误信息是：

grid.Call.graphics 中的错误（C_setviewport，vp，TRUE）：非有限 视口的位置和/或大小另外：警告消息：1： 不建议对离散变量使用大小。 2：删除了 16 行 包含缺失值 (geom_point)。

有人对如何解决这个问题有任何建议吗？

【问题讨论】：

我怀疑您使用因子的原因是因为您希望最小的与最大的相当，等等。您可以做的是，如果默认的大小调整方法对您来说过于极端，您可以在使用它来设置大小之前转换大小变量（例如平方根）。

欢迎来到 Stack Overflow。请make this question reproducible 包含一个纯文本格式的小型代表性数据集 - 例如dput(findings) 的输出，如果不是太大的话。

【参考方案1】：

这似乎是分箱大小比例的一个很好的用例，通过它您可以完全规避将变量设置为一个因素。

library(ggplot2)
#> Warning: package 'ggplot2' was built under R version 4.1.1

# Dummy data
rct_findings <- data.frame(
  Effect_Size_Study = rnorm(100),
  F_test_var_stat = runif(100),
  Outcome_Sample_Size = runif(100, min = 6, max = 10000)
)

ggplot(rct_findings, aes(x = Effect_Size_Study, y = F_test_var_stat)) +
  geom_point(aes(size = Outcome_Sample_Size)) +
  scale_size_binned_area(
    limits = c(0, 10000),
    breaks = c(0, 100, 500, 1000, 5000, 10000),
  )

^{由reprex package (v2.0.1) 于 2021 年 12 月 14 日创建}

【讨论】：

非常感谢您！效果很好！