将 3D 表面保存为 pdf 时出现黑线：我怎样才能摆脱它们？

Posted 2023-05-08

【中文标题】将 3D 表面保存为 pdf 时出现黑线：我怎样才能摆脱它们？

【英文标题】：Black lines when saving 3D surface to pdf: How can I get rid of them?

【发布时间】：2015-04-23 11:46:00

【问题描述】：

我有以下代码来使用 ax.plot_surface 显示 3D 表面：

fig = plt.figure()
ax  = fig.gca(projection='3d')
X,Y = np.meshgrid(range(k_mean.shape[0]), range(k_mean.shape[1])) 
Z   = k_mean
surf = ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1, linewidth=0., alpha=0.8, cmap=cm.nipy_spectral, antialiased=False, shade=False)
cset = ax.contour(X, Y, Z, zdir='z', offset=0, cmap=cm.nipy_spectral)
cset = ax.contour(X, Y, Z, zdir='x', offset=0, cmap=cm.nipy_spectral)
cset = ax.contour(X, Y, Z, zdir='y', offset=120, cmap=cm.nipy_spectral)

ax.set_xlim(0, 120)
ax.set_ylim(0, 120)
ax.set_zlim(0, 1)

fig.colorbar(surf, shrink=0.5, aspect=5)
plt.show()
plt.savefig('3d.pdf', dpi=500)

在 Spyder 中显示的绘图是“正确的”，但 PDF 似乎忽略了linewidth=0.。我该如何解决？

Spyder 输出：

PDF 输出：

【问题讨论】：

这在***.com/questions/17766481/… 之前出现，但不清楚是否已修复

啊，非常感谢！我没找到那个！

【参考方案1】：

matplotlib github 认为这是已修复的，但该修复并未进入 v1.4.1，但将被放入 v1.4.3 https://github.com/matplotlib/matplotlib/issues/2247

【讨论】：

谢谢！我现在将我的 matplotlib 更新到最新版本 1.4.3，一切正常！

【参考方案2】：

正如其他人所指出的，这与 pdf 后端中的错误有关，应该在最新版本的 matplotlib 中解决。

这是一种 hack / 变通方法，可以在旧版本中获得更吸引人的结果。您可以将 edgecolor 显式设置为完全透明：

surf = ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1, cmap=cm.coolwarm,
        linewidth=0, antialiased=True, edgecolor=(0,0,0,0))

比较结果：

编辑：

正如 cmets 中所指出的，使用 alpha 关键字会覆盖边缘颜色的 alpha 值。因此，我们需要明确定义面部颜色的透明度。我能看到的最简单的方法是调整颜色图：

from matplotlib.colors import LinearSegmentedColormap

colors = np.array(cm.coolwarm(np.linspace(0,1,256)))
colors[:,3] = 0.6
cmap = LinearSegmentedColormap.from_list('alpha_cmap', colors.tolist())

surf = ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1, cmap=cmap,
        linewidth=0, antialiased=True, edgecolor=(0,0,0,0))

结果：

【讨论】：

万一有人尝试这样做（这似乎可行）：除了设置 edgecolor 之外，此修复程序还需要排除 alpha 关键字参数 - 即使 apha=1.0 似乎也无法正常工作。

好点。 alpha 关键字覆盖（几乎？）所有 matplotlib 函数中的颜色特定 alpha 值。

@paddyg 我添加了一个如何为面部颜色添加透明度的示例。