倾斜的窗口函数和 Hive 源分区?
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【中文标题】倾斜的窗口函数和 Hive 源分区?【英文标题】:Skewed Window Function & Hive Source Partitions? 【发布时间】:2019-06-24 17:04:32 【问题描述】:我通过 Spark 读取的数据是高度倾斜的 Hive 表,具有以下统计信息。
(MIN、25TH、MEDIAN、75TH、MAX)通过 Spark UI:
1506.0 B / 0 232.4 KB / 27288 247.3 KB / 29025 371.0 KB / 42669 269.0 MB / 27197137
我相信当我执行一些Window Funcs
和Pivots
时,它会在工作的下游引起问题。
我尝试探索这个参数来限制分区大小,但是没有任何改变,并且分区在读取时仍然倾斜。
spark.conf.set("spark.sql.files.maxPartitionBytes")
另外,当我使用 Hive 表作为源缓存这个 DF 时,它需要几分钟,甚至在 Spark UI 中导致一些 GC,这很可能也是因为偏斜。
spark.sql.files.maxPartitionBytes
是否适用于 Hive 表或仅适用于文件?
处理这种倾斜的 Hive 源的最佳做法是什么?
写到 parquet 或 Salting 的舞台屏障之类的东西是否适合这个问题?
我想避免读取.repartition()
,因为它会在已经数据过山车的作业中添加另一层。
谢谢
================================================ ===
经过进一步研究,Window Function
似乎也导致数据倾斜,这就是Spark Job
挂起的地方。
我正在通过双重Window Function
执行一些time series
填充(向前然后向后填充以估算所有null
传感器读数)并尝试按照本文尝试salt
方法来均匀分布.. . 但是下面的代码会产生所有null
值,所以salt
方法不起作用。
不知道为什么我在Window
之后得到skews
,因为我分区的每个度量项在通过.groupBy()
检查后具有大致相同数量的记录......因此为什么需要salt
?
+--------------------+-------+
| measure | count|
+--------------------+-------+
| v1 |5030265|
| v2 |5009780|
| v3 |5030526|
| v4 |5030504|
...
盐帖 => https://medium.com/appsflyer/salting-your-spark-to-scale-e6f1c87dd18
nSaltBins = 300 # based off number of "measure" values
df_fill = df_fill.withColumn("salt", (F.rand() * nSaltBins).cast("int"))
# FILLS [FORWARD + BACKWARD]
window = Window.partitionBy('measure')\
.orderBy('measure', 'date')\
.rowsBetween(Window.unboundedPreceding, 0)
# FORWARD FILLING IMPUTER
ffill_imputer = F.last(df_fill['new_value'], ignorenulls=True)\
.over(window)
fill_measure_DF = df_fill.withColumn('value_impute_temp', ffill_imputer)\
.drop("value", "new_value")
window = Window.partitionBy('measure')\
.orderBy('measure', 'date')\
.rowsBetween(0,Window.unboundedFollowing)
# BACKWARD FILLING IMPUTER
bfill_imputer = F.first(df_fill['value_impute_temp'], ignorenulls=True)\
.over(window)
df_fill = df_fill.withColumn('value_impute_final', bfill_imputer)\
.drop("value_impute_temp")
【问题讨论】:
我相信当我执行一些 Window Funcs 和 Pivots 时,它会导致下游作业出现问题 - 这不太可能。具有较高概率的窗口函数和枢轴是导致性能问题的那些,因为两者都非常昂贵。但是,如果不了解更多有关表属性和执行计划的信息,则无法确定。 可能...但问题出在最终的write
上,该rdd
捆绑了skewed input, window, and pivot transformations
的特定阶段,其中所有数据都在一个分区中,其余分区中是空的,所以工作就挂了。
我也怀疑所有人都理解障碍。但关键是你的散文太少了。
@thePurplePython。你能分享一些代码n表结构吗?
@vikrantrana 谢谢你,但我使用 spark 作为处理引擎而不是配置单元......将尝试分享一些东西......倾斜的源是一个问题,但根本原因似乎是带有倾斜的窗口函数分区......这里也处理时间序列数据......我正在尝试salt
方法
【参考方案1】:
Hive based solution :
您可以使用配置单元配置启用倾斜连接优化。适用的设置有:
set hive.optimize.skewjoin=true;
set hive.skewjoin.key=500000;
set hive.skewjoin.mapjoin.map.tasks=10000;
set hive.skewjoin.mapjoin.min.split=33554432;
请参阅 databricks 提示:
skew hints 在这种情况下可能会起作用
【讨论】:
倾斜提示是专有的 Databricks 扩展,不是吗?如果我没记错的话,Spark 会忽略 Hive 倾斜选项。 是的,此功能特定于 databricks,尚未针对开源 spark 发布 如果你没事请关注accept answer as owner【参考方案2】:在单个分区大到无法放入单个执行程序的内存的情况下,加盐可能会有所帮助。即使所有密钥也平均分布(如您的情况),这也可能发生。
您必须在您用于创建窗口的 partitionBy 子句中包含 salt 列。
window = Window.partitionBy('measure', 'salt')\
.orderBy('measure', 'date')\
.rowsBetween(Window.unboundedPreceding, 0)
您必须再次创建另一个窗口,该窗口将对中间结果进行操作
window1 = Window.partitionBy('measure')\
.orderBy('measure', 'date')\
.rowsBetween(Window.unboundedPreceding, 0)
【讨论】:
以上是关于倾斜的窗口函数和 Hive 源分区?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章