OrientationJ：从 OrientationJ 向量场宏中保存结果的问题

Posted 2023-04-14

【中文标题】OrientationJ：从 OrientationJ 向量场宏中保存结果的问题

【英文标题】：OrientationJ: Problem saving results from OrientationJ vector field macro

【发布时间】：2022-01-05 07:21:35

【问题描述】：

我正在尝试为 ImageJ 编写一个宏，它通过 OrientationJ Vector Field 插件处理指定文件夹中的图像，然后将输出的结果表保存到单独的文件夹中。问题是，当我运行宏时，会弹出 OrientationJ Vector Field 的对话框，但结果并未保存在任何地方。我不确定我做错了什么，如果有人可以帮助我，我将不胜感激。我的宏代码如下所示，谢谢。

dir1 = getDirectory("Choose Source Directory ");
dir2 = getDirectory("Choose Destination Directory ");
list = getFileList(dir1);
setBatchMode(true);
for (i=0; i<list.length; i++) 
    showProgress(i+1, list.length);
    filename = dir1 + list[i];
    if (endsWith(filename, "tif")) 
        open(filename);
        run("8-bit");
        run("OrientationJ Vector Field");
        run("OrientationJ Vector Field", "tensor=2.0 gradient=0 radian=on vectorgrid=50 vectorscale=80.0 vectortype=0 vectoroverlay=off vectortable=on ");
        saveAs("Results", dir2+list[i]+".csv");
        close();
    
 

【参考方案1】：

您是否尝试过使用其他 ImageJ 插件，例如“Orientations_”？ https://www.gluender.de/Miscellanea/MiscTexts/UtilitiesText.html#Gl-2020-1 ImageJ-宏调用： run("方向", "局部直径=16 指标");

【讨论】：

感谢您的回复。我不想使用其他插件，因为 OrientationJ 是我首选的方向分析工具。您知道如何获取宏以保存 .csv 结果吗？我在网上看到有其他人有类似的问题，但还没有看到解决方案。

如果你有表格显示使用：nme = Table.title; path = "/Users/yourName/Downloads/"; Table.save(路径+nme+".csv");

【参考方案2】：

更新：已通过手动将 OrientationJ 更新到 2.0.5（从 2020 年 5 月起）解决了问题。在旧版本中，矢量场不适用于宏。最新版本可以在 OrientationJ 网站上找到：http://bigwww.epfl.ch/demo/orientationj/

斐济没有最新版本的 O.J.包括在内，因此需要手动安装最新版本。