python lmfit程序没有运行

Posted 2023-03-30

【中文标题】python lmfit程序没有运行

【英文标题】：python lmfit program not running

【发布时间】：2019-03-09 18:42:59

【问题描述】：

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

from lmfit.model import load_model


def mysine(x, amp, freq, shift):
    return amp * np.sin(x*freq + shift)



data = np.loadtxt('sinedata.dat')
x = data[:, 0]
y = data[:, 1]

model = load_model('sinemodel.sav', funcdefs='mysine': mysine)
params = model.make_params(amp=3, freq=0.52, shift=0)
params['shift'].max = 1
params['shift'].min = -1
params['amp'].min = 0.0

result = model.fit(y, params, x=x)
print(result.fit_report())

plt.plot(x, y, 'bo')
plt.plot(x, result.best_fit, 'r-')
plt.show()

Traceback（最近一次通话最后一次）：

文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\IPython\core\interactiveshell.py”，第 2910 行，在 run_code exec(code_obj, self.user_global_ns, self.user_ns)

文件“”，第 4 行，在 从 lmfit.model 导入 load_model

文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\lmfit__init__.py”，第 39 行，在 from .confidence import conf_interval, conf_interval2d

文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\lmfit\confidence.py”，第 10 行，在 从 .minimizer 导入 MinimizerException

文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\lmfit\minimizer.py”，第 34 行，在 进口不确定性

文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\uncertainties__init__.py”，第 224 行，在 从 .core 导入 *

文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\uncertainties\core.py”，第 2889 行 POSITIVE_DECIMAL_UNSIGNED_OR_NON_FINITE = ur'((\d*)(.\d*)?|nan|NAN|inf|INF)' ^ SyntaxError: 无效语法

【问题讨论】：

请提供错误的完整回溯。不确定性的导入似乎失败了，但这里还不足以知道原因（无效的语法可能表明 Python 版本问题）。尝试一个简单的import uncertainties 和import uncertainties.core（例如，只需在 Python 提示符下输入）并调查或报告完整的回溯。

我真的不知道发生了什么。我也尝试了与 lmfit 相关的不同程序，但出现了同样的错误。

文件“”，第 1 行，在 中导入不确定性文件“C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\uncertainties_ init_.py"，第 224 行，在 中从 .core 导入 * 文件 "C:\Users\MUHAMMAD ALI QURESHI\Anaconda3\lib\site-packages\uncertainties\core.py"，第 2889 行 POSITIVE_DECIMAL_UNSIGNED_OR_NON_FINITE = ur'((\d*)(\.\d*)?|nan|NAN|inf|INF)' ^ SyntaxError: invalid syntax

我无法弄清楚实际问题是什么。不确定包还是python版本问题。

我也在Ipython控制台尝试了import lmfit，同样的错误存在

【参考方案1】：

我认为您需要重新安装uncertainties。看起来您拥有的代码正在使用 Python2 语法。

我相信uncertainties 需要（自动）在安装时使用2to3 tool——看起来其中的某些部分对您不起作用。

应该可以这样做：

C:\.....\Anaconda3\Scripts\pip.exe install --force-reinstall uncertainties

【讨论】：

我从 github 下载了不确定性并将文件放在站点包中。这东西通常对我有用，但在 lmfit 的情况下它不是。如果你想让我重新安装不确定性，请把它的链接发给我。

首先，问题出在uncertainties，而不是lmfit。更重要的是，不要将place the file in site-packages 与安装软件包混淆——这解释了您所看到的问题。相反，您需要使用pip install uncertainties 安装软件包，如其自身说明和上述答案中所述。您遇到的问题似乎是因为您没有按照安装说明进行操作。两次。希望这有助于说明为什么遵循说明很重要。

好的。让我用适当的协议安装它。

使用 pip 我刚刚从 bootstrap.pypa.io/get-pip.py 下载了 pip-19.0.3... 之后我疯了，不知道现在该做什么 .. :(

好吧，如果你使用 anaconda python，你可以先conda install pip 然后pip install uncertainties。或者，您可以使用conda 来安装uncertainties，因为有几个conda 频道可以使用uncertainties，包括conda-forge。但是您的问题是关于为什么lmfit 不起作用，而不是关于如何使用有据可查的pip 和/或conda 来安装Python 包。无论如何，答案告诉你究竟如何运行pip install。