有没有办法使用给定目录中的 numpy.genfromtxt 从 csv 读取数据？

Posted 2023-03-25

【中文标题】有没有办法使用给定目录中的 numpy.genfromtxt 从 csv 读取数据？

【英文标题】：Is there a way to read data from csv using numpy.genfromtxt from a given directory?

【发布时间】：2021-11-20 16:04:21

【问题描述】：

我应该通过 argparse 读取 csv 文件路径。例如，csv 文件的路径是 args.X，我该如何将这些数据加载到 2d numpy 数组中？现在我使用的是Data = np.genfromtxt(args.X, delimiter=",")，这在 args.X 包含文件名而不是路径并且文件与 python 脚本位于同一文件夹中时有效。当数据不在同一个文件夹中并且我获得了文件的路径时如何读取？

【问题讨论】：

它会抛出任何错误吗？是FileNotFoundError

我的路径是 D:\Amit\ell409\2019anz1787\gaussian.csv 作为输入，错误是“D:Amitell4092019anz1787gaussian.csv not found”

这不是 Windows 中的有效路径...我想你的意思是 D:\\Amitell4092019anz1787gaussian.csv 对吧？

所有反斜杠都被杀死了。我会更新我的答案

【参考方案1】：

您似乎遇到了反斜杠消失的问题，这很奇怪。无论如何，您最好告诉 argparse 您想要一个 Path 对象（并使用一个）。你可能想要这样的代码：

import numpy as np
from pathlib import Path
from argparse import ArgumentParser
parser = ArgumentParser()
parser.add_argument("IN", type=Path)
parser.parse_args()

inf = args.IN.expanduser().resolve()
if not inf.exists():
    raise FileNotFoundError(f"No such file: inf")
Data = np.genfromtxt(inf, delimiter=",")

【讨论】：

谢谢！这行得通

如果确实如此，请随意接受 :) 作为在黑暗中的镜头，我认为某些字符串转义出了问题，因为您在错误消息中缺少 any 斜杠。但通常使用 Path 作为路径，它要容易得多

是的，事实证明，由于某些转义序列，斜线被丢弃