R plot 条件颜色（具有多个条件）

Posted 2023-03-24

【中文标题】R plot 条件颜色（具有多个条件）

【英文标题】：R plot conditional color (with more than one condition)

【发布时间】：2016-09-15 15:53:27

【问题描述】：

我正在尝试在 R 中生成一个图，如果数据点满足条件 X 和条件 Y OR 条件 Z 和条件 Y，则它们会被着色。

我可以为这个论点的一半生成一个图表——即：如果满足条件 X 和 Y，则为颜色。

plot(mydata$Mean, mydata$log2FoldChange, cex=0.3, pch=20, 
col=ifelse(mydata$foldChange>2 & mydata$pval<0.05, "red", "black"), log="x", 
xlab="mydata$mean", ylab="mydata$log2foldchange")

看起来像：this

理想情况下，我希望图表的下半部分为类似条件着色：pval

我试过了：

plot(mydata$Mean, mydata$log2FoldChange, cex=0.3,pch=20, col=ifelse(mydata$foldChange>2 & mydata$padj<0.05, "red", "black"), col=ifelse(mydata$foldChange<0.2 & mydata$padj<0.05, "blue", "black") log="x", xlab="mydata$mean", ylab="mydata$log2foldchange")

但它会抛出一个错误：

错误：“plot(mydata$Mean, mydata$log2FoldChange, cex=0.3,pch=20, col=ifelse(mydata$foldChange>2 & mydatar$padj

我只是不确定如何在 R 中包含“或”语句。感谢您的帮助，我对 R 还是很陌生！

【问题讨论】：

可能是c("red","black")[with(mydata, (condition1) | (condition2) ) + 1] 之类的？

【参考方案1】：

怎么样：

col=ifelse(mydata$padj<0.05, ifelse(mydata$foldChange>2,"red", ifelse(mydata$foldChange<0.2 , "blue", "black"), "black"), "black")

【讨论】：

太棒了！不得不重新安排一下，但类似的东西效果很好：plot(mydata$Mean, mydata$log2FoldChange, cex=0.3, pch=20, col=ifelse(mydatar$foldChange>2 & mydata$padj<0.05, "red", ifelse(mydata$foldChange<0.2 & mydata$padj<0.05, "blue", "black")), log="x")