为啥我会收到“未使用的参数(na.action = NULL)”错误?
Posted
技术标签:
【中文标题】为啥我会收到“未使用的参数(na.action = NULL)”错误?【英文标题】:Why do I get "unused argument (na.action = NULL)" error in aggregate?为什么我会收到“未使用的参数(na.action = NULL)”错误? 【发布时间】:2022-01-17 20:17:37 【问题描述】:我汇总了包含NA
s 的数据,因此我包括na.action = NULL
,如here 所述。这是有效的代码:
# Toy data.
df <- data.frame(x= 1:10, group= rep(1:2, 5), other_var= rnorm(10))
# Aggragate with formula.
aggregate(formula= x ~ group, data= df, na.action= NULL, FUN= function(i) sum(i))
在我的情况下,我无法提供变量名称作为公式,因为它们可以更改。因此,我在x
和by
参数中为他们提供了一个字符串向量,如下所示:
var_names <- c("x", "group")
aggregate(x= df[ , var_names[1]], by= list(df[ , var_names[2]]), na.action= NULL, FUN= function(i) sum(i))
这会导致错误。有趣的是,省略了na.action= NULL
,例如aggregate(x= df[ , var_names[1]], by= list(df[ , var_names[2]]), FUN= function(i) sum(i))
,不会以错误结束,而是返回预期的输出。在提供列名作为向量时,如何避免包含 NA
s 的行消失?我确实需要包含na.action= NULL
,因为我的真实数据包含NA
s。
【问题讨论】:
研究文档。只有aggregate.formula
有 na.action
参数。
我觉得你的例子令人困惑。链接的帖子描述了一种不同的情况,即如果您在公式的 LHS 上有.
。既然你没有那个,我不明白你为什么要摆弄na.action
参数。
@Roland 你说得对,我的示例数据不好。它甚至不包含 NA。我只是制作数据来重现错误。当然,我的真实数据看起来不一样。
【参考方案1】:
您不必使用 aggregate.formula
中的列名。na.pass
应该可以解决您的 na.action
要求。
setNames(
aggregate( cbind(df[,1], df[,3]) ~ df[,2], df, sum, na.rm=T,
na.action=na.pass ), colnames(df[,c(2,1,3)]) )
group x other_var
1 1 25 -0.7313815
2 2 30 0.3231317
数据
(我加了NA
s)
df <- structure(list(x = 1:10, group = c(1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L,
2L, 1L, 2L), other_var = c(-1.79458090358371, 0.295106071151792,
NA, -0.589487588239041, 0.325944874015228, NA, 0.737254570399201,
0.47849317537615, NA, 0.139020009150021)), row.names = c(NA,
-10L), class = "data.frame")
【讨论】:
【参考方案2】:我不完全确定问题出在哪里:分配 na.action=NULL
意味着忽略它们并将包括它们的 NA
s 在内的任何值传递给函数,原封不动。这是非公式版本默认情况下会发生的情况。
所以我建议你省略 na.action
。
使用mtcars
:
mt <- mtcars
mt$mpg[3] <- NA
var_names <- c("mpg", "cyl")
一、公式变体:
aggregate(
as.formula(paste(var_names[1], "~", var_names[2])), data= mt,
na.action= NULL,
FUN= function(i) sum(i))
# cyl mpg
# 1 4 NA
# 2 6 138.2
# 3 8 211.4
二、非公式失败:
aggregate(
x= mt[ , var_names[1]], by= list(mt[ , var_names[2]]),
na.action= NULL,
FUN= function(i) sum(i))
# Error in FUN(X[[i]], ...) : unused argument (na.action = NULL)
修复它:
aggregate(
x= mt[ , var_names[1]], by= list(mt[ , var_names[2]]),
# na.action= NULL,
FUN= function(i) sum(i))
# Group.1 x
# 1 4 NA
# 2 6 138.2
# 3 8 211.4
如果您想要第一组的总和,则可以在函数本身中处理它:
aggregate(
x= mt[ , var_names[1]], by= list(mt[ , var_names[2]]),
FUN= function(i) sum(i, na.rm=TRUE))
# Group.1 x
# 1 4 270.5
# 2 6 138.2
# 3 8 211.4
【讨论】:
好的,那么您是否有理由选择不使用公式版本(如我的回答所示)?它是唯一使用您认为必须使用的na.action=
的aggregate
方法。【参考方案3】:
这段代码应该可以解决你的问题。
aggregate(x = df[which(!is.na(df[var_names[1]])), var_names[1]],
by = list(df[which(!is.na(df[var_names[1]])), var_names[2]]),
FUN = function(i) sum(i))
【讨论】:
以上是关于为啥我会收到“未使用的参数(na.action = NULL)”错误?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章