Dplyr 后端无法找到适用于“sql_translate_env”的方法

Posted 2023-03-24

【中文标题】Dplyr 后端无法找到适用于“sql_translate_env”的方法

【英文标题】：Dplyr backend is not able to find applicable method for 'sql_translate_env'

【发布时间】：2017-03-03 09:53:16

【问题描述】：

我尝试在 monetdb SQL 后端运行一个简单的 dplyr 命令。连接本身似乎有效，但 dplyr 调用失败。我重新启动了RSession并尝试再次重新安装MonetDB.R包，但没有成功。

library(dplyr)
db <- MonetDB.R::src_monetdb("ai_db", user="analyst", host="monetdb.local", password="mypassword")

## works!
DBI::dbGetQuery(db$con, "SELECT count(*) from users")

## fails
db %>% tbl("users") %>% mutate(n= n())

来源：查询 [?? x 7] 数据库：MonetDB 11.25.5 (Dec2016-SP1)

UseMethod("sql_translate_env") 中的错误：没有适用的方法 'sql_translate_env' 应用于“MonetDBConnection”类的对象

我使用 docker 容器 (rocker/verse:3.3.2) 中的默认存储库/设置 (packages.install("dplyr")) 安装了 dplyr。

更新 1：MonetDBLite 改为 MonetDB.R

现在我安装了 MonetDBLite 并使用以下代码创建连接：

con <- mc(dbname="ai_db", user="analyst", password="mypassword", host="monetdb.local",
          timeout=86400000)
db <- MonetDBLite::src_monetdb("ai_db",con=con)

我设置了一个相当高的超时，因为错误消息指示一个低（见下文）。但是，命令再次失败，我认为它与超时无关，因为它立即失败。

## fails
db %>% tbl("users") %>% mutate(n= n())

来源：查询 [?? x 7] 数据库：MonetDB 11.25.5 (Dec2016-SP1)

.mapiRead(conObj@connenv$socket) 中的错误：来自的空响应 MonetDB 服务器，可能是超时。您可以增加等待时间 用于对 'dbConnect()' 的带有 'timeout' 参数的响应。

数据集非常小（只有 5000 个条目），所以这应该没什么大不了的。 MonetDB 安装在同一台服务器上并且运行良好，DBI 接口也可以正常工作（并在一秒钟内返回结果）：

DBI::dbGetQuery(con, "SELECT count(*) from videos")

更新 2：

现在我尝试了 MonetdbLite 的开发版本和存储库中的稳定 CRAN 版本。两者都失败了，但有不同的错误。

packages.install("MonetDBLite")
db <- MonetDBLite::src_monetdb("ai_db", user="analyst", password="mypassword", host="monetdb.local")
db %>% tbl("users") %>% mutate(n= n())

来源：查询 [?? x 7] 数据库：MonetDB 11.25.5 (Dec2016-SP1)

.mapiRead(conObj@connenv$socket) 中的错误：来自的空响应 MonetDB 服务器，可能是超时。您可以增加等待时间 用于对 'dbConnect()' 的带有 'timeout' 参数的响应。

devtools::install_github( "hannesmuehleisen/MonetDBLite" )
db <- MonetDBLite::src_monetdb("ai_db", user="analyst", password="mypassword", host="monetdb.local")
db %>% tbl("users") %>% mutate(n= n())

来源：查询 [?? x 7] 继承错误(con_acquire(x), “MonetDBEmbeddedConnection”）：找不到函数 “con_acquire”

【问题讨论】：

嗨，语法正确吗？ cran.rstudio.com/web/packages/dplyr/vignettes/databases.html

通过测试用例：github.com/hannesmuehleisen/MonetDBLite/blob/master/tests/… 你可能需要devtools::install_github( "hannesmuehleisen/MonetDBLite" ) 不确定

@AnthonyDamico 我先尝试了src_monetdb("ai_db", user="analyst", password="mypassword", host="monetdb.local")，但后来我不得不重写它来设置超时（我总是遇到这个烦人的超时错误）。我将尝试在接下来的几天内安装开发版本，但我希望我能获得稳定的 CRAN 版本（我使用的是预构建的 docker 映像，我更喜欢不需要安装所有 monetdb 的解决方案依赖项（例如，libmonetdb5.so)）。

@AnthonyDamico 好的，这不是依赖问题，我只需要正确设置权限，然后我就可以使用 devtools 安装包。最新版本也失败了，但出现了不同的错误（我已经更新了我的帖子）。

您是指ajdamico/lodown 库吗？这应该修复缺少的con_acquire 函数还是 CRAN monetDBLite 版本？我安装了它并再次尝试安装 MonetdbLite devtools，但我仍然收到相同的错误 (could not find function "con_acquire")

【参考方案1】：

请改用 MonetDBLite 包，它也包含连接独立服务器的代码