如何在 R 中保存与输入 tiff 完全相同尺寸的 tiff 背景图像
Posted
技术标签:
【中文标题】如何在 R 中保存与输入 tiff 完全相同尺寸的 tiff 背景图像【英文标题】:How do I save a tiff background image in R with exactly the same dimensions as my input tiff 【发布时间】:2020-07-17 14:35:04 【问题描述】:我正在使用 ggplot 在 R 中添加背景图像。我在一个迭代过程中这样做,构建多个具有相同背景的幻灯片。
我有一个 tiff 格式的输入世界地图,我将其读入 ggmap 进程,然后将其写为 tiff 文件。
world map with urban areas highlighted
我有两个问题需要帮助: 1. 与输入文件相比,保存的世界地图图片略微向右下方写入。仔细看才能看到这一点。 2. 保存的文件丢失分辨率。
world_background <-tiff::readTIFF("world_background_in.tiff", native = TRUE)
myplt <- ggplot() +
theme_void() + theme(legend.position="none") +
annotation_custom(rasterGrob(world_background,
width = unit(1,"npc"),
height = unit(1,"npc")),
-Inf, Inf, -Inf, Inf) +
scale_x_continuous(limits = c(-180, 180)) +
scale_y_continuous(limits = c(-79.99688, 79.99825))
tiff("world_packground_out.tiff", width=1024, height=580, res=300, compression = "lzw")
print(myplt)
dev.off()
如果您在迭代的基础上运行此程序,使用保存的文件作为下一次迭代的输入,您将看到世界图片在您生成的每个输出中向下和向右滑动,并且分辨率变得越来越粗糙。
关于将图像保持在完全相同的位置有什么建议吗?以及如何保持我的决心?
注意:上传的图片以png格式保存(我认为!)。如果你用 png 输入运行我的代码,问题是一样的
【问题讨论】:
【参考方案1】:不确定您面临的问题是什么,回复太长而无法在评论中发布,因此是一个答案。
我正在使用magick::image_read()
来读取背景图片。由于我不知道您要绘制什么,因此我使用 mtcars
作为示例数据集来检查它是否在循环中工作 - 要绘制的变量和 scale_y_continuous
都取决于列绘制可能与您的用例相似。
lapply(c('data.table', 'ggplot2', 'grid', 'png', 'magick'),
library, character.only = T)
img <- image_read('https://i.stack.imgur.com/IwjyT.png')
dat <- as.data.table(mtcars)
plot_list <- lapply(colnames(dat)[1:5], function(z)
plt <- ggplot(dat, aes_string(x = 'wt', y = z)) +
theme(legend.position = 'none') +
annotation_custom(grob = rasterGrob(image = img,
width = unit(1, 'npc'),
height = unit(1, 'npc')),
xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = -Inf, ymax = Inf) +
geom_point() + geom_line() +
scale_x_continuous(limits = dat[, range(wt)]) +
scale_y_continuous(limits = dat[, range(get(z))])
ggsave(filename = sprintf('%s vs Wt.png', z), plot = plt, device = 'png')
return(plt)
)
我发现绘图没有问题 - 通过在本地保存绘图来确认。图像大小唯一存在差异的情况是 y 轴的刻度线有更多数字(例如,绘制 cyl
与绘制 hp
时)。
我也用theme_void
对此进行了测试 - 它只删除了 x、y 轴,对绘图本身没有任何影响。
【讨论】:
我的投票没有显示“因为我是“新手”。不过谢谢【参考方案2】:更新:
我将“保存”功能从“tiff + print”保存更改为“ggsave”保存。
@gautam 提供的答案给了我方向
另外我发现了这个enter link description here
代码现在看起来像这样
world_background <-tiff::readTIFF("world_background_in.tiff", native = TRUE)
myplt <- ggplot() +
theme_void() + theme(legend.position="none") +
annotation_custom(rasterGrob(world_background,
width = unit(1,"npc"),
height = unit(1,"npc")),
-Inf, Inf, -Inf, Inf) +
scale_x_continuous(limits = c(-180, 180)) +
scale_y_continuous(limits = c(-79.99688, 79.99825))
ggsave("world_packground_out.tiff", width=10.4, height=5.89, dpi=600, units="in", compression = "lzw")
#print(myplt)
#dev.off()
【讨论】:
以上是关于如何在 R 中保存与输入 tiff 完全相同尺寸的 tiff 背景图像的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
为啥 tiff 输出看起来与 R studio 中的 ggplot2 输出不同?
R语言ggplot2可视化指定保存到pdf的图像的具体尺寸保证缩放的一致性:使得绘图元素(文本点大小等)在设计上都具有相同的绝对大小设置全局数据点大小主题格式设置图像保存的具体尺寸