(Python) Networkx - 定义自己的 pos 字典

Posted 2023-03-17

【中文标题】(Python) Networkx - 定义自己的 pos 字典

【英文标题】：(Python) Networkx - Define own pos dictionary

【发布时间】：2019-03-29 23:08:23

【问题描述】：

我的代码是这样的：

for x in xrange(5):
    G.add_edge('sIP:\n'+mostfrequent[x][0], countermfi[x])
    G.add_edge('dIP:\n'+mostfrequent[x][1], countermfi[x])
    G.add_edge('sPort:\n'+mostfrequent[x][2], countermfi[x])
    G.add_edge('dPort:\n'+mostfrequent[x][3], countermfi[x])
    G.add_edge('Protocol:\n'+mostfrequent[x][4], countermfi[x])
    G.add_edge('Packets:\n'+mostfrequent[x][5], countermfi[x])
    G.add_edge('Bytes:\n'+mostfrequent[x][6], countermfi[x])


pos = nx.kamada_kawai_layout(G)  # positions for all nodes

#Hyperedges
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=countermfi, node_size=node_size, node_color='red', node_shape='s', alpha=1)             

#Nodes          
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=flattened_list_nodes, node_size=1600, node_color='blue', alpha=0.6)             

#Edges
nx.draw_networkx_edges(G, pos, edgelist=G.edges(), width=2)

#Labels
nx.draw_networkx_labels(G, pos, font_size=11, font_family='sans-serif')
plt.axis('off')
plt.show()

我的 print G.nodes(data=True) 输出是：

[('Bytes:\n620', ), ('dIP:\n178.237.19.228', ), ('sPort:\n2049', ), ('sPort:\n60179', ), ('sIP:\n16.37.97.29', ), (153, ), ('dPort:\n443', ), ('dPort:\n80', ), ('Packets:\n2', ), ('Packets:\n1', ), ('sPort:\n44492', ), ('Bytes:\n100', ), ('sIP:\n16.37.93.196', ), ('dIP:\n178.237.17.97', ), (188, ), ('dIP:\n16.37.157.74', ), ('sIP:\n16.37.97.222', ), ('dIP:\n178.237.17.61', ), ('sIP:\n16.37.97.17', ), ('Bytes:\n46', ), (224, ), (227, ), ('dPort:\n691', ), ('dIP:\n104.131.44.62', ), ('sPort:\n55177', ), ('Protocol:\n6', ), (120, ), ('sPort:\n56326', )]

我在使用 nx.kamada_kawai_layout 时遇到问题，因为我收到一个错误：

raise nx.NetworkXError('Node %s has no position.' % e)
networkx.exception.NetworkXError: Node '16.37.97.17' has no position.

如何解决这个问题或为 40 个节点中的每一个设置我自己的位置？

提前谢谢你， 问候:)

【参考方案1】：

根据您的other question，您的问题是出现在flattened_list_nodes 中的节点'16.37.97.17' 不是 图中的节点。添加边时，您在节点名称中附加了一些文本。所以你添加了节点'sIP:\n16.37.97.17'

然后您要求 networkx 绘制节点 '16.37.97.17'，但这不是图表的一部分，因此，pos 没有它的位置。所以它会失败。您需要在将节点添加到图表之前不更改节点名称，或者在 nodelist 中使用更改后的名称。

即使您为该节点定义了位置，它仍然无法绘制，因为该节点不在图表中。

【讨论】：

好的，我明白了，但是我如何修复它以在数据前面仍然有标签？我可以使用 for 循环将标签添加到 flattened_list_nodes 吗？或者什么是最好的解决方案？那么我如何为节点设置我自己的 pos 字典呢？

不要在节点名称中添加额外的文本，而是查看***.com/a/28533293/2966723 的最后一部分。如果您真的想在节点名称中添加文本，则需要更新节点列表以包含该额外文本。否则，在您要求它绘制'16.37.97.17' 的绘图命令中，它无法知道它真的应该绘制'sIP:\n16.37.97.17'。但是您最好的选择是更新节点标签，而不是更新我链接到的答案中的节点名称。