如何在 Keras 模型中训练和验证样本较小时测量过拟合
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【中文标题】如何在 Keras 模型中训练和验证样本较小时测量过拟合【英文标题】:How to measure overfitting when train and validation sample is small in Keras model 【发布时间】:2018-07-18 10:58:23 【问题描述】:我有以下情节:
使用以下数量的样本创建模型:
class1 class2
train 20 20
validate 21 13
据我了解,情节表明没有过度拟合。但我觉得, 由于样本很小,我不确定模型是否通用 足够的。
除了上图还有其他方法可以衡量过拟合吗?
这是我的完整代码:
library(keras)
library(tidyverse)
train_dir <- "data/train/"
validation_dir <- "data/validate/"
# Making model ------------------------------------------------------------
conv_base <- application_vgg16(
weights = "imagenet",
include_top = FALSE,
input_shape = c(150, 150, 3)
)
# VGG16 based model -------------------------------------------------------
# Works better with regularizer
model <- keras_model_sequential() %>%
conv_base() %>%
layer_flatten() %>%
layer_dense(units = 256, activation = "relu", kernel_regularizer = regularizer_l1(l = 0.01)) %>%
layer_dense(units = 1, activation = "sigmoid")
summary(model)
length(model$trainable_weights)
freeze_weights(conv_base)
length(model$trainable_weights)
# Train model -------------------------------------------------------------
desired_batch_size <- 20
train_datagen <- image_data_generator(
rescale = 1 / 255,
rotation_range = 40,
width_shift_range = 0.2,
height_shift_range = 0.2,
shear_range = 0.2,
zoom_range = 0.2,
horizontal_flip = TRUE,
fill_mode = "nearest"
)
# Note that the validation data shouldn't be augmented!
test_datagen <- image_data_generator(rescale = 1 / 255)
train_generator <- flow_images_from_directory(
train_dir, # Target directory
train_datagen, # Data generator
target_size = c(150, 150), # Resizes all images to 150 × 150
shuffle = TRUE,
seed = 1,
batch_size = desired_batch_size, # was 20
class_mode = "binary" # binary_crossentropy loss for binary labels
)
validation_generator <- flow_images_from_directory(
validation_dir,
test_datagen,
target_size = c(150, 150),
shuffle = TRUE,
seed = 1,
batch_size = desired_batch_size,
class_mode = "binary"
)
# Fine tuning -------------------------------------------------------------
unfreeze_weights(conv_base, from = "block3_conv1")
# Compile model -----------------------------------------------------------
model %>% compile(
loss = "binary_crossentropy",
optimizer = optimizer_rmsprop(lr = 2e-5),
metrics = c("accuracy")
)
# Evaluate by epochs ---------------------------------------------------------------
# # This create plots accuracy of various epochs (slow)
history <- model %>% fit_generator(
train_generator,
steps_per_epoch = 100,
epochs = 15, # was 50
validation_data = validation_generator,
validation_steps = 50
)
plot(history)
【问题讨论】:
您使用的是 RStudio 教程中的 keras 默认值吗? tensorflow.rstudio.com/blog/…。它看起来像,但只是检查。如果您可以提供示例数据,那就太好了。我的方法是在更大的公共数据集上进行训练,然后在该上下文中分析小型私有数据。您也可以尝试交换训练和验证数据并比较结果。 【参考方案1】:如果你想测量你当前模型的过度拟合,你可以在你的小测试集上测试模型,每次从validate set
中选择34个样本,即通过函数sample
和设置replace=TRUE
。通过从validate set
中选择您替换的样本,您将能够创建更多“极端”数据集,从而更好地估计预测可能会根据您的可用数据而变化。此方法称为 bagging 或 bootstrap 聚合。
【讨论】:
【参考方案2】:您的验证损失始终低于训练损失。我会很怀疑你的结果。 如果您查看验证准确性,它不应该是那样的。
您拥有的数据越少,您对任何事情的信心就越低。因此,当您不确定过度拟合时,您是对的。唯一可行的方法是收集更多数据,或者通过数据增强,或者与另一个数据集结合。
【讨论】:
【参考方案3】:这里有两件事:
根据 w.r.t 对数据进行分层类 - 您的验证数据具有与您的训练集完全不同的类分布(训练集是平衡的,而验证集 - 不是)。这可能会影响您的损失和指标值。最好对结果进行分层,这样两组的班级比例相同。
由于数据点太少,使用更粗略的验证模式 - 您可能会看到总共只有 74 张图像。在这种情况下 - 将所有图像加载到 numpy.array
不是问题(您仍然可以使用 flow
函数进行数据扩充)并使用当您将数据放在文件夹中时很难获得的验证模式。我建议您使用的模式(来自sklearn
)是:
【讨论】:
另一种需要考虑的方法,用很少的数据点进行训练,将是 k 折交叉验证的扩展,即“带混洗的迭代 k 折交叉验证”:1) 混洗数据, 2) 执行 k 折交叉验证。执行步骤 1 和 2 共 N 次;然后计算最终分数,取每次运行 k 折交叉验证时获得的分数的平均值。在这种情况下(即数据点数量少),这个分数会比只执行一个 k 倍精确得多。但是,由于需要学习 K×N 个模型,因此计算成本可能更高。【参考方案4】:我建议将预测视为下一步。
例如,从上图和提供的样本数量来看,您的验证预测在两种准确度之间波动,而这些预测之间的差异恰好是一个猜对了的样本。
因此,与拟合无关,您的模型预测的结果或多或少相同(加减一个观察值)。这是一个不好的迹象。
此外,特征和可训练参数(权重)的数量对于提供的样本数量来说太高了。所有这些权重都没有机会实际训练。
【讨论】:
以上是关于如何在 Keras 模型中训练和验证样本较小时测量过拟合的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
keras 如何保存训练集与验证集正确率的差最小那次epoch的网络及权重