keras plot_model 告诉我安装 pydot

Posted 2023-03-12

【中文标题】keras plot_model 告诉我安装 pydot

【英文标题】：keras plot_model tells me to install pydot

【发布时间】：2018-04-21 16:11:03

【问题描述】：

我在 Windows 10 机器上使用 python 3.6.3。我通过以下方式使用 pip install 安装了 pydot 和 graphviz：

    py -m pip install pydot
    py -m pip install graphviz

我还去了graphviz网站并在此处下载并安装了Windows版本：http://www.graphviz.org/Download_windows.php默认安装到程序文件（x86）。但是当我在 keras 中绘制我的模型时，我仍然收到错误消息，说我必须安装 pydot 和 graphviz 并且导入失败。我可以的

    import pydot
    import graphviz

在我的 python 控制台上很好，它们不会抛出任何错误。我还应该做什么才能绘制我的神经网络？

【问题讨论】：

试试：py -m pip3 install pydot py -m pip3 install graphviz

我没有 pip3。但通常如果我只使用已经用于 python 3 cus 的“py -m pip”来进入 python 2，我必须执行 py -2.7 -m pip install...等。另外，我用 python 3 测试了 import 语句，它可以工作。

【参考方案1】：

安装的 GraphViz 可执行文件（dot、neato 等）的路径需要在PATH environment variable 中，以便pydot 找到它们。 pydot在早期版本中用于搜索那些可执行文件，但not any more。

还有：

pydot 是一个 Python 包。 GraphViz 是一组用于计算图形布局的工具 written in C graphviz 是一个与 pydot 完全无关的 Python 包。这两个 Python 包不以任何方式相互交互。安装其中一个就足够了（连同 GraphViz）。

另见：

https://github.com/erocarrera/pydot/issues/126 https://github.com/erocarrera/pydot/commit/812e3c40dac1e0225391481073c64da5bafba93e#commitcomment-18236709 https://github.com/erocarrera/pydot/commit/812e3c40dac1e0225391481073c64da5bafba93e#commitcomment-18222580

以及来自那里的链接。

【讨论】：

那是否意味着我必须进入pydot的源代码并手动添加graphviz的路径？

我想通了，抱歉，我以前从未对我的 Windows PATH 变量进行过编辑。

如果用户直接调用pydot（而不是通过keras或其他中介），那么中间的解决方案是通过Dot.write_*的prog参数传递路径或Dot.create_* 方法（参见 this docstring）。但是，不鼓励使用此解决方案。最好设置一个环境配置，并在重新安装操作系统时复制它。在 *nix 系统中，这通常在 ~/.bashrc 中完成（我建议将此配置文件提交到 git 存储库）。

用完整的程序查看这个答案 -> ***.com/a/50025414/6126603

@dataLeo keras >= 2.1.6 已更新为pydot 的最新版本：github.com/keras-team/keras/pull/9904

【参考方案2】：

作为@Ioannis 答案的补充，您必须通过 conda (conda install GraphViz) 安装 GraphViz 可执行文件。

就我而言，安装 GraphViz 后，我尝试使用最新的 pydot (pip install pydot) 并解决了错误。

【参考方案3】：

为了完成@dataLeo 的解决方案，Python 3 用户可以使用 pydotplus 包而不是 pydot-ng 包。总结一下：

通过命令“conda install pydot”和“conda install -c conda-forge pydotplus”安装 pydot+graphviz 和 pydotplus。 转到 vis_utils.py 文件并将第 11 行从 import pydot 更改为 import pydotplus as pydot。

PS：您可以通过在 ipython 控制台中查看 plot_model 命令的帮助来找到 vis_utils.py 文件，即在from keras.utils import plot_model 之后，在 ipython 控制台中键入 ??plot_model。

使用 Anaconda python-3.6 在 Windows 10-64 位上测试

【参考方案4】：

我通过安装软件包解决了这个问题：

conda install graphviz
conda install pydot
conda install pydotplus