如何在 WEKA 中打印出交叉验证后的预测类
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【中文标题】如何在 WEKA 中打印出交叉验证后的预测类【英文标题】:How to print out the predicted class after cross-validation in WEKA 【发布时间】:2011-11-10 23:54:56 【问题描述】:使用分类器完成 10 倍交叉验证后,如何打印出每个实例的预测类以及这些实例的分布?
J48 j48 = new J48();
Evaluation eval = new Evaluation(newData);
eval.crossValidateModel(j48, newData, 10, new Random(1));
当我尝试类似下面的操作时,它说分类器没有构建。
for (int i=0; i<data.numInstances(); i++)
System.out.println(j48.distributionForInstance(newData.instance(i)));
我正在尝试做的是与 WEKA GUI 中相同的功能,其中一旦训练了分类器,我可以点击 Visualize classifier error" > Save
,我会在文件中找到预测的类。但现在我需要它来使用我自己的 Java 代码。
我尝试过类似以下的方法:
J48 j48 = new J48();
Evaluation eval = new Evaluation(newData);
StringBuffer forPredictionsPrinting = new StringBuffer();
weka.core.Range attsToOutput = null;
Boolean outputDistribution = new Boolean(true);
eval.crossValidateModel(j48, newData, 10, new Random(1), forPredictionsPrinting, attsToOutput, outputDistribution);
但它提示我错误:
Exception in thread "main" java.lang.ClassCastException: java.lang.StringBuffer cannot be cast to weka.classifiers.evaluation.output.prediction.AbstractOutput
【问题讨论】:
【参考方案1】:crossValidateModel()
方法可以采用 forPredictionsPrinting
varargs
参数,该参数是 weka.classifiers.evaluation.output.prediction.AbstractOutput
实例。
其中重要的部分是StringBuffer
,用于保存所有预测的字符串表示。以下代码在未经测试的JRuby
中,但您应该能够根据需要对其进行转换。
j48 = j48.new
eval = Evalution.new(newData)
predictions = java.lange.StringBuffer.new
eval.crossValidateModel(j48, newData, 10, Random.new(1), predictions, Range.new('1'), true)
# variable predictions now hold a string of all the individual predictions
【讨论】:
但是在 weka.sourceforge.net/doc 我没有看到任何 crossValidateModel 选项作为您的描述,您介意指出正确的文档或我可以看到此类信息的地方吗?欣赏!! 见weka.sourceforge.net/doc.dev/weka/classifiers/…。 SO 似乎没有正确解析片段标识符,因此向下滚动到第一个 crossValidateModel 方法签名。 请查看我对这个问题的编辑。我尝试了一些你的建议......但它提示我错误,不确定我做错了什么。请帮忙!!谢谢!! 我并没有真正将 weka 与 Java 一起使用,仅在 JRuby 中使用上述代码。尝试创建一个 PlainText 对象,该对象扩展 AbstractOutput(例如称为输出)实例并调用output.setBuffer(forPredictionsPrinting)
并将其传入而不是缓冲区。
它有效!!!!非常感谢!!但是对于 PlainText 实例或 StringBuffer 实例,有没有办法获得第 i 个实例的结果?我还注意到返回的预测包括“inst# 实际预测误差预测”,但 GUI 包含“inst#, actual, predicted, error, probability distribution”(包括所有类的分布)。我可以知道为什么它们不同吗?我怎样才能得到像 GUI 一样的呢?【参考方案2】:
几天前我被困住了。我想使用矩阵而不是从 arff 文件加载来评估 matlab 中的 Weka 分类器。我使用http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/21204-matlab-weka-interface 和以下源代码。我希望这对其他人有帮助。
import weka.classifiers.*;
import java.util.*
wekaClassifier = javaObject('weka.classifiers.trees.J48');
wekaClassifier.buildClassifier(processed);%Loaded from loadARFF
e = javaObject('weka.classifiers.Evaluation',processed);%Loaded from loadARFF
myrand = Random(1);
plainText = javaObject('weka.classifiers.evaluation.output.prediction.PlainText');
buffer = javaObject('java.lang.StringBuffer');
plainText.setBuffer(buffer)
bool = javaObject('java.lang.Boolean',true);
range = javaObject('weka.core.Range','1');
array = javaArray('java.lang.Object',3);
array(1) = plainText;
array(2) = range;
array(3) = bool;
e.crossValidateModel(wekaClassifier,testing,10,myrand,array)
e.toClassDetailsString
Asdrúbal López-Chau
【讨论】:
【参考方案3】:clc
clear
%Load from disk
fileDataset = 'cm1.arff';
myPath = 'C:\Users\Asdrubal\Google Drive\Respaldo\DoctoradoALCPC\Doctorado ALC PC\AlcMobile\AvTh\MyPapers\Papers2014\UnderOverSampling\data\Skewed\datasetsKeel\';
javaaddpath('C:\Users\Asdrubal\Google Drive\Respaldo\DoctoradoALCPC\Doctorado ALC PC\AlcMobile\JarsForExperiments\weka.jar');
wekaOBJ = loadARFF([myPath fileDataset]);
%Transform from data into Matlab
[data, featureNames, targetNDX, stringVals, relationName] = ...
weka2matlab(wekaOBJ,'[]');
%Create testing and training sets in matlab format (this can be improved)
[tam, dim] = size(data);
idx = randperm(tam);
testIdx = idx(1 : tam*0.3);
trainIdx = idx(tam*0.3 + 1:end);
trainSet = data(trainIdx,:);
testSet = data(testIdx,:);
%Trasnform the training and the testing sets into the Weka format
testingWeka = matlab2weka('testing', featureNames, testSet);
trainingWeka = matlab2weka('training', featureNames, trainSet);
%Now evaluate classifier
import weka.classifiers.*;
import java.util.*
wekaClassifier = javaObject('weka.classifiers.trees.J48');
wekaClassifier.buildClassifier(trainingWeka);
e = javaObject('weka.classifiers.Evaluation',trainingWeka);
myrand = Random(1);
plainText = javaObject('weka.classifiers.evaluation.output.prediction.PlainText');
buffer = javaObject('java.lang.StringBuffer');
plainText.setBuffer(buffer)
bool = javaObject('java.lang.Boolean',true);
range = javaObject('weka.core.Range','1');
array = javaArray('java.lang.Object',3);
array(1) = plainText;
array(2) = range;
array(3) = bool;
e.crossValidateModel(wekaClassifier,testingWeka,10,myrand,array)%U
e.toClassDetailsString
【讨论】:
以上是关于如何在 WEKA 中打印出交叉验证后的预测类的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何在 scikit-learn 中使用交叉验证获得预测概率